生薑的根包括纖維根和肉質根兩種。一般纖維根主要是吸收功能，肉質根主要是貯藏功能，同時具有吸收和支援功能。肉質根可食用，用於菜、餡等均可。通常於種姜播種以後，先從幼芽基部發生數條纖細的不定根，稱為纖維根，或稱初生根。出苗3天觀察，根長約5～7釐米，先端有少量根毛。20天后觀察，根長一般在10～15釐米，根毛已較前發達。此後，隨著幼苗的生長，纖維根數逐漸增多，並在其上發生許多細小的側根，形成姜的主要吸收根系。大約在9月中旬前後，植株正處在旺盛生長時期，此時，在薑母和子姜的下部節上，還可發生若干條肉質不定根，乳白色，形狀短而粗，一般長10～25釐米，直徑約0.5釐米，其上一般不發生側根，根毛也少，具有吸收和支援功能。肉質根可以食用。生薑為淺根性作物，分枝少，根系不甚發達。大部分根分佈在土壤上層30釐米以內的耕作層內，只有少量的根可伸入土壤下層，因此，吸收水肥能力較弱，對肥水條件要求比較嚴格。姜根的解剖結構與一般單子葉植物根的結構相似，從其橫剖面圖可見，最外層是表皮，表皮上有根毛，表皮以內為皮層，皮層的最內一圈為內皮層，再內是中柱部分。皮層位於表皮之內，由多層薄壁細胞組成，在根的橫切面上佔有較大比例。皮層細胞較大，排列較疏鬆，有明顯的細胞間隙，是根部貯藏營養物的場所，並具有一定的通氣作用。中柱包括中柱鞘、木質部、韌皮部和髓部薄壁細胞，中柱細胞較小而排列緊密，與皮層有明顯區別。生薑肉質不定根的解剖結構與纖維根基本相同，只是皮層部分較厚，細胞排列層數較多一些。