“civil engineering”翻譯為“土木工程”，要從兩個方面來看成因。
①“civil engineering”及相關詞彙的含義在不斷髮展變化。
有答主提到，“civil”在“civil engineering”中，作為與“military”相對立的概念，將含義限定在了“non-military”的範圍內，即與市政/民生/民事等相關；而後在不斷的發展中，最終變成專指與橋樑/道路/建築等相關的概念。
實際上，在法國，法文中的“ingénieur”一詞的意思最初的確是指“軍事工程師”，屬於軍隊序列。同樣的，在1797年之前出版的《大英百科全書》，也定義“engineer”為“有才能的軍事技術專家。除了運用完美的數學知識製作地圖，標記地面上所有要塞的位置以外，他們還專司攻擊和防禦。”
後來，法國這些軍隊的工程師開始涉足普通民生的事業，並最終出現了專於民生事業和民事工程的“génie civil”。Erwin Rockwell在其翻譯的《A History of Civil Engineering：An outline from Ancient to Modern Times》中提到，這種軍隊裡的“génie civil”被視為近代土木工程師的直系鼻祖。
由此，“ingénieur”一詞的含義也逐漸擴充套件。到了18世紀，在D.狄德羅主編的《百科全書》中，“ingénieur”一詞就分為了三個種類的工程師：軍事、海事和民生。
根據武上真理子對這一問題的研究，英文詞彙“civil engineer”第一次出現，源於英華人Smeaton在1768年的自稱。其後出現的組織The Institution of Civil Engineers於1828年獲得了英國皇室的敕準，加上了“Royal”的頭銜，而在敕準書裡，對“civil engineering”有這樣的定義：
很顯然，在這裡對“civil engineering”的定義，是處在非常寬泛的、目的在於“改變與利用”自然的一種技藝範疇，與現在專指的橋樑道路隧道範疇等等相去甚遠。但在另一方面，我們也可以看出，“civil engineering”作為一種“非軍事”的概念，已經開始從“engineer”原本所指的“軍事”的概念中剝離出來。換句話說，這些詞彙的概念內涵一直在發生變化。
在1853年至1860年間出版的《大英百科全書》第八版，“engineer”已經被定義為這樣一種職業：“從事發明、製作發動機和機械，並使其實用化”。在這一條後面，“military engineer”和“civil engineer”也被分別做了解釋。顯然，在這裡，“engineer”的含義已經擴充套件到了軍事以外的範圍。
另外，在第九版的《大英百科全書》中，除了以往就有的“engineer”，還新增了“engineering”的詞條，並分為了“civil”“military”“mining”和“mechanical”四大類。也要指出，這裡的“civil”包含了水運/道路/橋樑/鐵路/灌溉/電信等領域。
關於“engineering”內涵的變化這一點，武上真理子指出，18世紀初從軍務方面獨立出來的“civil engineering”，以首先派分出的“mechanical engineering”為標誌，逐漸將採礦、造船、化學和電氣等領域細分了出去，才形成了如今所說的“土木工程”。可以說，現代工程學的部分專業領域，正是這樣派生出來的。
而“civil engineering”被翻譯為中文中的“土木工程”和日文中的“土木工學”，也經過了一番考量和變化。
單從“civil engineering”的字面意思來看，不容易聯想到“土木”二字。實際上，在同處於漢字文化圈的日本，也（曾）使用“市民技術”“文化工學”“市民工學”甚至“都市工學”等來翻譯。
若把時間回溯到19世紀和20世紀，也可以看到“civil engineer”和“civil engineering”這些語彙被翻譯為中文時的情況。
從1866年到1939年，“civil engineer”的中文翻譯經歷了這麼一個變化的過程：“民大計，地官”→“土木工師，土木細作”→“土木工程師/工師”→“土木工程師，土木技師”。
而“civil engineering”這一詞條的翻譯，則在出現於1912年的《英華大辭典》和1939年的《綜合英漢大辭典》。在這兩本詞典中，其被譯為“工程、土木工學”。
其中，“土木”二字首先出現在1903年於上海出版的《華英音韻字典整合》。考慮到這個時間節點左右有大量來自歐美日的著作被譯介到國內，並且以梁啟超為代表的人物，在介紹同樣使用漢字的日本譯著方面，做了大量工作，大量日製漢字詞被引入國內，也是一個不可忽略的因素，因此有必要考察日本的詞典中是如何翻譯這些詞彙的。
典型地，1896年冬，康有為以「東京書籍出版営業者組合員書籍総目録」為底本編纂《日本書目志》時，在“工業門”下就直接採用了日文翻譯的“土木”二字，把“土木學”譯介到了國內。
藤田龍之指出，“土木”一詞，在日文中首次作為與“civil”相關的翻譯而出現，應該是在1873年於橫濱出版的『附音挿図英和字彙』中。這本詞典裡，“civil engineer”被看作一個整體，譯為「土木方」。追溯這一翻譯，著名的《韋氏大詞典》與之密不可分。
1868年的《韋氏大詞典》在定義“engineering”時，也將其分為了“civil ”和“military”兩部分，並說明了前者是與“設計機器和建設道路以及運河等“相關的公共事業，並且指出“特指鐵路、運河、自來水、橋樑、燈塔……隧道等“。可以看出，這時“civil engineering”的定義，已經相當接近現在的說法。
考慮到“土木”二字，無論在中國還是在日本，都是自古以來就使用的詞彙，因此按照上述這些西方詞典的底本來翻譯的日文詞典，會採用“土木”二字也就不足為奇。武上真理子認為，明治初期的日本採用“土木”二字來翻譯，可能與當時的政府機構設定有關。真田秀吉在其「土木と雲う語」一文中梳理了明治時代（1868年）以來，土木二字在日本政府機關中的使用變化：
借鑑政府設定的機構名稱來翻譯，當然只是一家之言。
此外，日本的明治初期，也有人將《錢伯斯百科全書》中的“civil engineering”翻譯為“土木術”和“土工術”。值得一提的是，當時甚至有將“civil engineering”定為“建築學”的情況。這些無不反映了一個事實：彼時的“civil engineering”作為一個甫入東亞世界的名詞，其含義搖擺不定。究其原因主要有兩方面，第一在於這個詞彙在那時的西方也正處於不斷變化的情況之中，第二在於當時沒有完全應對的漢字詞去翻譯。（不得不說如果按現在日本引入外來語的尿性，估計就直接叫 「シヴィル」了）。
實際上，有也觀點認為，“土木”二字的翻譯取自中國典籍。例如《淮南子》：
這種觀點有一定的說服力。因為不管是中國，還是日本，在面對來勢洶洶的外來語時，都曾嘗試從古典漢籍中尋找合適的漢字來翻譯，而這都源於漢字強大的造詞能力。例如中國以“格物致知”為根據，將physics譯為“格致學”“格物學”，又如日本翻譯revolution時，從“湯武革命，順乎天而應乎人”中擷取“革命”二字作為應對。
總之，“civil engineering”本身的含義不斷變化，從最初的“民用萬工之祖”開始，逐漸將建築、電氣、採礦、機械等領域分化出去，最終形成了如今所指的“土木工程”。而以中國和日本為代表的東亞文化圈的國家，在接受和學習這一詞彙時，也努力地用既有的概念範疇去對應。這其中，不但讓人感受到西學東漸帶來的衝擊，也令人體驗到近代以來，語言文字在東亞國家之間交流的奇妙旅程。這都值得去探究和思考。
【特別說明】
本答案主要參考了京都大學人文科學研究所學者武上真理子的論文「シヴィル・エンジニアリングの語と概念の翻訳——「市民の技術」とは何か」，該論文公開於京都大學人文研附屬中國研究中心的官網上。我在查詢資料的過程中，才發現武上老師已於2017年下半年去世。武上老師專門研究與中國相關的課題，尤其是在對中國民主革命先行者孫中山先生的研究上更是成果豐碩。在此對她及所有在中國學的研究上做出貢獻的學者致敬！
“civil engineering”翻譯為“土木工程”，要從兩個方面來看成因。
①“civil engineering”及相關詞彙的含義在不斷髮展變化。
有答主提到，“civil”在“civil engineering”中，作為與“military”相對立的概念，將含義限定在了“non-military”的範圍內，即與市政/民生/民事等相關；而後在不斷的發展中，最終變成專指與橋樑/道路/建築等相關的概念。
實際上，在法國，法文中的“ingénieur”一詞的意思最初的確是指“軍事工程師”，屬於軍隊序列。同樣的，在1797年之前出版的《大英百科全書》，也定義“engineer”為“有才能的軍事技術專家。除了運用完美的數學知識製作地圖，標記地面上所有要塞的位置以外，他們還專司攻擊和防禦。”
後來，法國這些軍隊的工程師開始涉足普通民生的事業，並最終出現了專於民生事業和民事工程的“génie civil”。Erwin Rockwell在其翻譯的《A History of Civil Engineering：An outline from Ancient to Modern Times》中提到，這種軍隊裡的“génie civil”被視為近代土木工程師的直系鼻祖。
由此，“ingénieur”一詞的含義也逐漸擴充套件。到了18世紀，在D.狄德羅主編的《百科全書》中，“ingénieur”一詞就分為了三個種類的工程師：軍事、海事和民生。
根據武上真理子對這一問題的研究，英文詞彙“civil engineer”第一次出現，源於英華人Smeaton在1768年的自稱。其後出現的組織The Institution of Civil Engineers於1828年獲得了英國皇室的敕準，加上了“Royal”的頭銜，而在敕準書裡，對“civil engineering”有這樣的定義：
The art of directing the Great Sources of Power in Nature for the use and convenience of man.很顯然，在這裡對“civil engineering”的定義，是處在非常寬泛的、目的在於“改變與利用”自然的一種技藝範疇，與現在專指的橋樑道路隧道範疇等等相去甚遠。但在另一方面，我們也可以看出，“civil engineering”作為一種“非軍事”的概念，已經開始從“engineer”原本所指的“軍事”的概念中剝離出來。換句話說，這些詞彙的概念內涵一直在發生變化。
在1853年至1860年間出版的《大英百科全書》第八版，“engineer”已經被定義為這樣一種職業：“從事發明、製作發動機和機械，並使其實用化”。在這一條後面，“military engineer”和“civil engineer”也被分別做了解釋。顯然，在這裡，“engineer”的含義已經擴充套件到了軍事以外的範圍。
另外，在第九版的《大英百科全書》中，除了以往就有的“engineer”，還新增了“engineering”的詞條，並分為了“civil”“military”“mining”和“mechanical”四大類。也要指出，這裡的“civil”包含了水運/道路/橋樑/鐵路/灌溉/電信等領域。
關於“engineering”內涵的變化這一點，武上真理子指出，18世紀初從軍務方面獨立出來的“civil engineering”，以首先派分出的“mechanical engineering”為標誌，逐漸將採礦、造船、化學和電氣等領域細分了出去，才形成了如今所說的“土木工程”。可以說，現代工程學的部分專業領域，正是這樣派生出來的。
而“civil engineering”被翻譯為中文中的“土木工程”和日文中的“土木工學”，也經過了一番考量和變化。
單從“civil engineering”的字面意思來看，不容易聯想到“土木”二字。實際上，在同處於漢字文化圈的日本，也（曾）使用“市民技術”“文化工學”“市民工學”甚至“都市工學”等來翻譯。
若把時間回溯到19世紀和20世紀，也可以看到“civil engineer”和“civil engineering”這些語彙被翻譯為中文時的情況。
從1866年到1939年，“civil engineer”的中文翻譯經歷了這麼一個變化的過程：“民大計，地官”→“土木工師，土木細作”→“土木工程師/工師”→“土木工程師，土木技師”。
而“civil engineering”這一詞條的翻譯，則在出現於1912年的《英華大辭典》和1939年的《綜合英漢大辭典》。在這兩本詞典中，其被譯為“工程、土木工學”。
其中，“土木”二字首先出現在1903年於上海出版的《華英音韻字典整合》。考慮到這個時間節點左右有大量來自歐美日的著作被譯介到國內，並且以梁啟超為代表的人物，在介紹同樣使用漢字的日本譯著方面，做了大量工作，大量日製漢字詞被引入國內，也是一個不可忽略的因素，因此有必要考察日本的詞典中是如何翻譯這些詞彙的。
典型地，1896年冬，康有為以「東京書籍出版営業者組合員書籍総目録」為底本編纂《日本書目志》時，在“工業門”下就直接採用了日文翻譯的“土木”二字，把“土木學”譯介到了國內。
藤田龍之指出，“土木”一詞，在日文中首次作為與“civil”相關的翻譯而出現，應該是在1873年於橫濱出版的『附音挿図英和字彙』中。這本詞典裡，“civil engineer”被看作一個整體，譯為「土木方」。追溯這一翻譯，著名的《韋氏大詞典》與之密不可分。
1868年的《韋氏大詞典》在定義“engineering”時，也將其分為了“civil ”和“military”兩部分，並說明了前者是與“設計機器和建設道路以及運河等“相關的公共事業，並且指出“特指鐵路、運河、自來水、橋樑、燈塔……隧道等“。可以看出，這時“civil engineering”的定義，已經相當接近現在的說法。
考慮到“土木”二字，無論在中國還是在日本，都是自古以來就使用的詞彙，因此按照上述這些西方詞典的底本來翻譯的日文詞典，會採用“土木”二字也就不足為奇。武上真理子認為，明治初期的日本採用“土木”二字來翻譯，可能與當時的政府機構設定有關。真田秀吉在其「土木と雲う語」一文中梳理了明治時代（1868年）以來，土木二字在日本政府機關中的使用變化：
明治維新匆々には、明治元年十月太政官內に治河使を置き、二年四月八日民部官を置き、其內に土木司を置いた。同七月八日民部省と改名す。四年七月二十九日民部省廃せられ、土木司は工部省に移され、八月土木寮と改名された。六年十一月十日內務省設けられ、土木寮は其管內に移った。十年一月各省の寮は局と改めて土木局となった。此名稱は六十五年間続いて、昭和十六年九月六日より國土局と改名されたが、僅々七年にて、二十三年一月一日より建設院となり、同時に技師は技官と改名した。七月十一日建設省と改稱された。……一方民間では土木の名を用ひ、土木請負雲々の語もあって、建築工事もやって居る。借鑑政府設定的機構名稱來翻譯，當然只是一家之言。
此外，日本的明治初期，也有人將《錢伯斯百科全書》中的“civil engineering”翻譯為“土木術”和“土工術”。值得一提的是，當時甚至有將“civil engineering”定為“建築學”的情況。這些無不反映了一個事實：彼時的“civil engineering”作為一個甫入東亞世界的名詞，其含義搖擺不定。究其原因主要有兩方面，第一在於這個詞彙在那時的西方也正處於不斷變化的情況之中，第二在於當時沒有完全應對的漢字詞去翻譯。（不得不說如果按現在日本引入外來語的尿性，估計就直接叫 「シヴィル」了）。
實際上，有也觀點認為，“土木”二字的翻譯取自中國典籍。例如《淮南子》：
古者民澤處複穴，冬日即不勝霜雪霧露，夏日即不勝暑熱蚊虻。聖人乃作為之築土構木，以為宮室，上樑下宇，以蔽風雨，以避寒暑，而百姓安之。這種觀點有一定的說服力。因為不管是中國，還是日本，在面對來勢洶洶的外來語時，都曾嘗試從古典漢籍中尋找合適的漢字來翻譯，而這都源於漢字強大的造詞能力。例如中國以“格物致知”為根據，將physics譯為“格致學”“格物學”，又如日本翻譯revolution時，從“湯武革命，順乎天而應乎人”中擷取“革命”二字作為應對。
總之，“civil engineering”本身的含義不斷變化，從最初的“民用萬工之祖”開始，逐漸將建築、電氣、採礦、機械等領域分化出去，最終形成了如今所指的“土木工程”。而以中國和日本為代表的東亞文化圈的國家，在接受和學習這一詞彙時，也努力地用既有的概念範疇去對應。這其中，不但讓人感受到西學東漸帶來的衝擊，也令人體驗到近代以來，語言文字在東亞國家之間交流的奇妙旅程。這都值得去探究和思考。
【特別說明】
本答案主要參考了京都大學人文科學研究所學者武上真理子的論文「シヴィル・エンジニアリングの語と概念の翻訳——「市民の技術」とは何か」，該論文公開於京都大學人文研附屬中國研究中心的官網上。我在查詢資料的過程中，才發現武上老師已於2017年下半年去世。武上老師專門研究與中國相關的課題，尤其是在對中國民主革命先行者孫中山先生的研究上更是成果豐碩。在此對她及所有在中國學的研究上做出貢獻的學者致敬！