1、形成機制不同

垂直分工體系是市場發育後形成的一種自然分工體系。歐美等國家旅行社經過百多年的發展，形成了旅遊批發商、旅遊經營商、旅遊零售商的縱向序列。

水平分工體系是指按照旅遊市場和業務範圍進行的分工，每類旅行社的經營活動都涉及從生產、設計、開發旅遊產品到旅遊接待的各個環節，並無批發、零售的主營差異。

2、劃分不同

垂直分工體系是以專業化分工為特徵的，使得旅行社各司其職。旅遊批發商專司旅遊產品的設計、組裝；旅遊經營商從事旅遊產品的設計、組裝並提供旅遊接待服務；旅遊零售商則專門負責旅遊產品的代理銷售。與此同時，也形成了大、中、小旅行社的規模化、專業化、網路化的特點。

水平分工體系，按照市場經營業務範圍不同，人為地將旅行社劃分為國際旅行社和國內旅行社兩大類，同時，又把統一的國內旅遊市場按部門和地區進行劃分，分別設立相應的旅遊企業。

3、優勢不同

垂直分工體系比較好地做到了營銷策劃統一、採購統一、銷售統一、操作統一，有利於保障有序的市場競爭和規模經濟的形成，有利於降低運營成本，提高效益，克服了因缺乏分工而導致的業務交叉覆蓋，混亂競爭等弊端，使得整個旅行社的經營變得協調有序。

水平分工體系，曾體現出合理性，適應了傳統計劃經濟的要求，對旅行社較快地形成規模，換取國家建設所需要的外匯，發揮了一定的作用。但隨著市場經濟的深入發展，越來越顯露出諸多的弊端，如旅行社之間業務重疊，效率較低，成本較高；低層次的惡性價格競爭，使得市場混亂，旅遊服務質量難以保證。