在巴基斯坦的東面，曾有一塊被印度本土隔離的飛地，原名為東巴基斯坦，這就是今天的孟加拉國。在1971年以前，東巴基斯坦一直是巴基斯坦的領土。不過從巴基斯坦獨立開始，東巴就對現狀十分不滿。

1947年印巴分治以後，英屬印度殖民地獨立為巴基斯坦和印度兩個國家。按照《蒙巴頓方案》，東巴基斯坦地區也歸巴基斯坦所有。不過，以穆吉布·拉赫曼為首的東巴人民聯盟要求東巴基斯坦實行自治，並不斷謀求脫離巴基斯坦。這是因為東巴基斯坦地區的人口幾乎是巴基斯坦本土（西巴）的兩倍，但經濟落後、發展遲緩，不甘於被巴基斯坦統治的東巴希望獨立自主。

1970年的12月7日，東巴基斯坦遭受了嚴重的洪災和旋風。拉赫曼指責巴基斯坦政府救災不力，煽動東巴人民進行遊行示威。同時，他又秘密與印度方面接觸，希望印度在軍事上對巴基斯坦施壓，以促成東巴基斯坦的獨立。巴基斯坦的葉海亞總統為了控制局勢，在東巴進行了武力鎮壓。

就在巴基斯坦鎮壓東巴叛亂的過程中，印度政府卻在國際社會上製造輿論，指責巴基斯坦軍隊血腥屠殺居民，並宣佈印度將出兵幫助東巴基斯坦人民取得獨立，第三次印巴戰爭就是由此而來的。1971年11月21日，印軍10萬大軍兵分7路進攻巴基斯坦，並利用海軍優勢封鎖巴基斯坦沿海。巴基斯坦為了捍衛國家主權和領土完整，雖進行了一番拼死抵抗，但終因力量懸殊而失敗。12月16日，印軍佔領達卡地區，控制了整個東巴基斯坦，第三次印巴戰爭以巴基斯坦慘敗而告終。

美國政府為了防止巴基斯坦被印度全部佔領，勒令正在太平洋執行任務的企業號航母率領一支由驅逐艦和核潛艇組成的特混艦隊進入印度洋，對印度沿海城市進行核威懾。雖然在國際社會的干預下，印度最終收手，但東巴基斯坦的獨立已經不可逆轉。

12月22日，東巴基斯坦正式改名為孟加拉人民共和國。第二年的1月7日，拉赫曼回到國內，成為孟加拉國曆史上第一任總統。東巴基斯坦的獨立使得巴基斯坦的實力大為受損，同時也加劇了印巴兩國之間的矛盾，但是獲得獨立的孟加拉國並卻並沒有因此走上正軌。由於國內政治不穩、物產貧瘠，時至今日，孟加拉國依然是全世界人口密度最高和最為貧困的農業國家之一。

嚴格意義上這是一種極其籠統的說法——不能說完全不對，但也的確存在問題：孟加拉是南亞次大陸上的一個地區，包括孟加拉國以及印度控制下的西孟加拉邦，歷史上的孟加拉地區甚至還一度涵蓋過印度的比哈爾邦、特里普拉邦和奧里薩邦，顯然除了今天的孟加拉國之外的後面這一系列地方都沒脫離印度。那麼說孟加拉國脫離了印度是否正確呢？嚴格意義上這仍是一種籠統的說法——實際上自1947年印巴分治以後今天孟加拉國的轄區並不屬於印度，而是屬於巴基斯坦，所以嚴格意義上應該說是巴基斯坦先脫離英屬印度而獨立，然後孟加拉國又脫離了巴基斯坦，其間經歷了一段相對比較複雜的過程。然而這給我們留下了兩個疑惑：其一從地圖上看孟加拉國距離印度顯然比巴基斯坦近得多，為什麼印巴分治時卻被劃歸巴基斯坦？其二既然已被劃歸巴基斯坦為什麼又要獨立呢？

印度次大陸在歷史上長期處於分裂狀態，事實上在英國殖民者到來前印度更多隻是一個地理文化上的概念，而不是一個統一的政治實體，在印度次大陸上分佈著大大小小的土邦王國，而孟加拉也是其中之一（這裡的孟加拉係指古代歷史上的孟加拉地區，包括如今印度境內的西孟加拉邦、比哈爾邦、特里普拉邦和奧里薩邦等在內）。作為世界四大文明之一的古印度文明曾一度囊括了整個南亞次大陸，今天的巴基斯坦、孟加拉國等地都曾是古印度文明覆蓋的地區。和華夏文明以黃河、長江兩大母親河為依託發源起來相類似的是古印度文明同樣是依託於印度河、恆河兩大母親河發源起來的。但古印度的兩條母親河與華夏文明的兩條母親河有很重大的一點差異：黃河和長江中下游是適宜農耕的沖積平原，兩條大河之間幾乎沒有什麼高山大河之類的天然地緣屏障阻隔；印度河與恆河之間卻隔著一片塔爾沙漠。雖然古印度文明最早起源於印度河流域，但恆河流域也是印度文明的重要源頭之一，尤其是印度歷史上第一個統一王朝孔雀王朝誕生於恆河流域，此後印度文明的中心逐漸向恆河流域轉移。

隨著印度文明的中心日益轉移到恆河流域，與恆河流域地緣距離相對疏遠的印度河流域漸漸衰落下來，逐漸成為印度文明的邊緣地區。而在印度河流域西北部是波斯和中亞的遊牧民族，他們不斷跨越興都庫什山脈進入印度河流域。13～16世紀突厥人和阿富汗人進入跨越興都庫什山脈進入印度河流域，他們在這一地區大力發展伊斯蘭教。1526年德里蘇丹國被蒙古和突厥混血的莫臥兒王朝取代，具有中亞突厥血統的莫臥兒王朝控制了印度絕大部分地區，開始在全印度大力推行伊斯蘭教。由於本土的印度教徒數量過於龐大，信仰伊斯蘭教的莫臥兒王朝無法將其完全同化，但仍透過向非伊斯蘭教徒徵收人頭稅等措施使伊斯蘭教在印度河流域逐漸站穩了腳跟，至此印度河流域由信仰印度教的雅利安人佔多數逐漸轉變為信仰伊斯蘭教突厥後裔佔多數。莫臥兒王朝雖然控制了印度絕大部分地區，但這種控制其實更多的是一種靠武力壓制的控制，地方上依然存在許多土邦王公，這些土邦王公實際上就是一個個半獨立的國中之國。18世紀的大英帝國透過殖民擴張和工業革命迅速崛起強大，強大的英國征服了四分五裂的印度。英國為了方便自己的統治，對各土邦王公採取分化瓦解之策，在宗教問題上也是對印度教徒和伊斯蘭教徒分而治之。

二戰後英國的殖民體系崩塌，英國在撤出印度之前的最後一個大動作就是印巴分治——按宗教信仰將昔日的印度分為印度和巴基斯坦兩國。當時的孟加拉西部地區以印度教徒為主，於是被劃歸印度並逐漸形成了今天的西孟加拉邦，而以伊斯蘭教徒為主的孟加拉東部地區則劃歸巴基斯坦。按理說這是一件令人匪夷所思之事——明明歷史上伊斯蘭教進入印度次大陸是從今天的巴基斯坦一帶而來，而孟加拉同這一帶在地理位置上相隔遙遠，為什麼會被伊斯蘭文明同化呢？這首先是因為信奉伊斯蘭教的莫臥兒王朝入主印度後大力推行伊斯蘭教的宗教政策所致——在莫臥兒王朝時期伊斯蘭教開始從西北部的印度河流域開始向印度全境擴張，然而最後只有在孟加拉伊斯蘭教算是真正站穩了腳跟。正如上文所說的莫臥兒王朝時期的印度存在許多半獨立的土邦王公，在他們之中不乏信奉印度教者，儘管莫臥兒王朝在印度大力推行伊斯蘭教，但為了避免過分刺激地方土邦王國並沒採取強制措施。既然絕大多數土邦王公都沒接受伊斯蘭教，那為什麼孟加拉會成為伊斯蘭教在印度次大陸上的突破口呢？孟加拉地處南亞次大陸的東北邊緣地帶。僅西部與印度本部核心區——恆河平原相毗鄰，至於北、東兩面在今天看來也與印度接壤，但已是印度文明的邊緣地帶，在歷史上今天印度的東北部地區曾長期處於藏緬語族的民族控制之下，加之德干高原的地緣阻隔作用，實際上使孟加拉成為了印度文明輻射的薄弱地帶，這自然使伊斯蘭文明在這一地區的傳播阻力大為減小。不過印度文明畢竟在孟加拉長期經略，而孟加拉又遠離其他伊斯蘭文明地域，因此並沒被伊斯蘭文明完全同化，而是形成了東部的伊斯蘭文明和西部的印度教文明並存的獨特格局。正因為如此在以宗教信仰為依據的《蒙巴頓方案》中孟加拉被一分為二：東部歸巴基斯坦，西部歸印度。

英國殖民印度時期印度內部仍存在很多處於半獨立狀態的土邦，英國對印度採取分而治之的策略——英國直轄地區稱為英屬印度，而在直轄地區之外英國仍認可土邦王公相對獨立的權利。根據印巴分治的決議：這些土邦有權自主選擇加入巴基斯坦或是印度，然而在某些土邦這一分治決議卻遭遇了尷尬——以至今印巴之間仍在爭議的克什米爾問題為例：克什米爾絕大多數公民信奉伊斯蘭教，然而當時統治克什米爾的王公卻是印度教徒，於是就倒向了印度，由此引發了第一次印巴戰爭，此後兩國之間還曾多次交鋒。

獨立後的巴基斯坦領土分為東巴基斯坦和西巴基斯坦兩部分，而在兩者之間隔著印度的龐大國土。巴基斯坦的主體部分位於西部，東巴基斯坦實際上成為了一塊遠離本土的飛地。即使在資訊諮詢已相當發達的今天擁有飛地的國家也屈指可數，在上個世紀的南亞地區以巴基斯坦的國力想要控制這樣一塊遠離本土的飛地其實並不容易，與此同時印度也不會放棄巴基斯坦這個可以被自己利用的軟肋。印巴分治完全依據於宗教信仰，而忽略東巴基斯坦和西巴基斯坦除了宗教信仰之外在民族文化上幾乎是完全不相通的：西巴基斯坦的主體民族是旁遮普人，其次是信德人、普什圖人和俾路支人，官方語言是烏爾都語；東巴基斯坦的主體民族是孟加拉人，其母語為孟加拉語。巴基斯坦中央政府為加強對遠離本土的東巴基斯坦的控制就在這裡強制推行烏爾都語，以試圖徹底同化東巴基斯坦地區，然而這引起了東巴基斯坦人民的牴觸。與此同時巴基斯坦在國內經濟建設上始終偏重於西部本土，而對東部飛地則顯得不太上心，久而久之雙方的恩怨日積月累。地理上的相互隔絕，民族、文化和語言的巨大差異以及東部人民認為自己受到的不公平待遇綜合在一起使東巴基斯坦對巴基斯坦中央政府的離心傾向越來越強。

1971年3月26日東巴基斯坦宣佈獨立並在4月於印度加爾各答成立孟加拉人民共和國臨時政府，隨後東巴基斯坦發生大規模動亂和難民潮。印度自然不會放棄這個打擊巴基斯坦的大好機會，於是出兵當時的東巴基斯坦，隨後戰爭又擴大到西巴基斯坦，最終釀成第三次印巴戰爭。當年12月16日印軍攻佔東巴首府達卡，東巴駐軍無條件投降，從此東巴基斯坦成為獨立的孟加拉國。既然孟加拉國的獨立是在印度的幫助下實現的，而孟加拉國之所以選擇從巴基斯坦獨立出來又是源於同巴基斯坦中央政府的矛盾，那麼獨立後的孟加拉國退出印巴之間的衝突對峙也就是順理成章之事了。

儘管如此，也並不是說孟加拉國和印度之間就完全沒有任何衝突。儘管孟加拉國的獨立是在印度的幫助下實現的，但國與國之間從來就沒有永遠的朋友，也沒有永久的敵人，只有永恆的利益。孟加拉國從獨立之日起就對印度試圖控制自己的盤算極為排斥，費盡千辛萬苦才從巴基斯坦獨立出來的孟加拉國自然不願又被印度所控制。與此同時印度和孟加拉國之間同樣存在領土爭端：印度在孟加拉國有飛地，孟加拉國在印度也有飛地——兩國互相共有飛地198塊。孟加拉國第一大河布拉馬普特拉河的上游有兩大支流：其一為發源於中國西藏的雅魯藏布江，其二為發源於印度的恆河，印度掌握著這兩大流域的上游，孟加拉國則指責印度的水利設施影響了位於下游的孟加拉國的用水。不過這樣的爭執都是孟加拉國和印度之間的區域性利益之爭，孟加拉國從沒想過要介入印巴爭端中。