1996年（1~42）
1 雲霄飛車殺人事件 B/S
2 董事長千金綁架事件
3 偶像密室殺人事件
4 大都會暗號地圖事件
5 新幹線大爆破事件
6 情人節殺人事件◆
7 每月一件禮物恐嚇事件
8 美術館殺人事件
9 天下第一夜祭殺人事件
10 足球選手恐嚇事件
12（13） 步美被綁架事件
13（14） 奇怪的尋親殺人事件
14（15） 謎樣的訊息狙擊事件◆
15（16） 消失的屍體殺人事件
16（17） 古董收藏家殺人事件
17（18） 百貨公司挾持事件◆
18（19） 六月新娘殺人事件
19（20） 電梯殺人事件◆
20（21） 鬼屋殺人事件
21（22） 電視臺外景隊殺人事件◆
22（23） 豪華客輪連續殺人事件（前篇）
23（24） 豪華客輪連續殺人事件（後篇）
24（25） 喪失記憶的美女事件◆
25（26） 真假人質綁票事件◆
26（27） 愛犬約翰殺人事件◆
27（28） 小五郎同學會殺人事件（前篇）
28（29） 小五郎同學會殺人事件（後篇）
29（30） 計算機殺人事件◆
30（31） 不在場證明殺人事件◆
31（32） 電視臺殺人事件
32（33） 咖啡廳殺人事件
33（34） 偵探團生還事件◆
34（35） 山莊繃帶怪人殺人事件（前篇）
35（36） 山莊繃帶怪人殺人事件（後篇）
36（37） 星期一晚上7:30殺人事件◆
37（38） 仙人掌花殺人事件◆
38（39） 赤鬼村火祭殺人事件
39（40） 企業家千金殺人事件（前篇）
40（41） 企業家千金殺人事件（後篇）
41（42） 優勝錦旗被割事件◆
42（43） 卡拉OK廳殺人事件
1997年（43~85）
43（44） 江戶川柯南誘拐事件
44（45） 堀田三兄弟殺人事件◆
45（46） 敷面膜殺人事件◆
46（47） 雪山山莊殺人事件
47（48） 健身俱樂部殺人事件◆
48（49） 外交官殺人事件（前篇） X
49（50） 外交官殺人事件（後篇） S/X
50（51） 圖書館殺人事件
51（52） Golf練習場殺人事件◆
53（55） 神秘兇器殺人事件◆
54（56） 電玩公司殺人事件 B
55（57） 列車手法殺人事件◆
56（58） 清潔車殺人事件◆
57（59） 福爾摩斯迷殺人事件（前篇） X
58（60） 福爾摩斯迷殺人事件（後篇） X
59（61） 首次購物殺人事件◆
60（62） 插畫畫家殺人事件
61（63） 幽靈船殺人事件（前篇）◆
62（64） 幽靈船殺人事件（後篇）◆
63（65） 大怪獸哥梅拉殺人事件
64（66） 第三個指紋殺人事件◆
65（67） 螃蟹和鯨魚綁架事件◆
66（68） 夜路殺人事件◆
67（69） 舞臺女演員殺人事件◆
68（70） 暗夜男爵殺人事件（事件篇）
69（71） 暗夜男爵殺人事件（疑惑篇）
70（72） 暗夜男爵殺人事件（解決篇）
71（73） 米花之狼殺人事件◆
72（74） 三胞胎別墅殺人事件
73（75） 少年偵探隊遇難事件◆
74（76） 死神陣內殺人事件◆
75（77） 金融公司社長殺人事件
77（80） 名門連續慘死事件（前篇） X
78（81） 名門連續慘死事件（後篇） X
79（82） 銀行強盜殺人事件◆
80（83） 流浪畫家殺人事件◆
81（84） 當紅歌星綁架事件（前篇）
82（85） 當紅歌星綁架事件（後篇）
83（86） 綜合醫院殺人事件◆
84（87） 滑雪別墅殺人事件（前篇）
85（88） 滑雪別墅殺人事件（後篇）
1998年（86~128）
86（89） 誘拐現場特定事件◆（注：該集根據漫畫《名偵探柯南特別篇》第1卷改編，並非青山剛昌的原作）
87（90） 白鶴報恩殺人事件◆
88（91） 德休拉別墅殺人事件（前篇）◆
89（92） 德休拉別墅殺人事件（後篇）◆
90（93） 花香殺人事件◆
91（94） 搶匪住院事件
92（95） 恐怖登山殺人事件（前篇）◆
93（96） 恐怖登山殺人事件（後篇）◆
94（97） 雪女傳說殺人事件◆
95（98） 小五郎約會殺人事件◆
97（103） 離別美酒殺人事件◆
98（104） 名陶藝家殺人事件（前篇）
99（105） 名陶藝家殺人事件（後篇）
100（106） 初戀情人回憶事件（前篇）
101（107） 初戀情人回憶事件（後篇）
102（108） 古裝演員殺人事件（前篇）
103（109） 古裝演員殺人事件（後篇）
104（110） 盜賊集團別墅事件（前篇）
105（111） 盜賊集團別墅事件（後篇）
106（112） 新聞照片殺人事件◆
107（113） 鼴鼠星人之謎事件（前篇）◆
108（114） 鼴鼠星人之謎事件（後篇）◆
109（115） 偵探團大追擊事件◆
110（116） 烹飪教室殺人事件（前篇）◆
111（117） 烹飪教室殺人事件（後篇）◆
112（118） 帝丹小學七大離奇事件
113（119） 白色海灘殺人事件◆（注：該集根據漫畫《名偵探柯南特別篇》第1卷改編，並非青山剛昌的原作）
114（120） 有氧潛水殺人事件（前篇）
115（121） 有氧潛水殺人事件（後篇）
116（122） 推理小說家失蹤事件（前篇）
117（123） 推理小說家失蹤事件（後篇） X
119（126） 假面超人殺人事件◆
120（127） 蜜蜂雞尾酒殺人事件◆
121（128） 浴室密室事件（前篇）
122（129） 浴室密室事件（後篇）
123（130） 天氣預報小姐綁架事件◆
124（131） 神秘的狙擊者殺人事件（前篇）◆
125（132） 神秘的狙擊者殺人事件（後篇）◆
126（133） 旅行劇團殺人事件（前篇）◆
127（134） 旅行劇團殺人事件（後篇）◆
1999年（129~173）
130（140） 競技場無差別脅迫事件（前篇）
131（141） 競技場無差別脅迫事件（後篇）
132（142） 魔術愛好者殺人事件（事件篇） K
133（143） 魔術愛好者殺人事件（疑惑篇） K
134（144） 魔術愛好者殺人事件（解決篇） K
135（145） 消失的兇器搜尋事件◆
136（146） 藍色古堡探索事件（前篇）
137（147） 藍色古堡探索事件（後篇）
138（148） 最終播映殺人事件（前篇）
139（149） 最終播映殺人事件（後篇）
140（150） SOS！步美傳達的訊息◆
141（151） 結婚前夕密室事件（前篇） X
142（152） 結婚前夕密室事件（後篇） X
143（153） 疑惑的天體觀測◆
144（154） 上野出發的北斗星3號（前篇）
145（155） 上野出發的北斗星3號（後篇）
146（156） 本廳刑事戀愛物語（前篇）
147（157） 本廳刑事戀愛物語（後篇）
148（158） 路上電車緊急剎車事件◆
149（159） 遊樂園高空彈跳事件◆
150（160） 汽車爆炸事件的真相（前篇）◆
151（161） 汽車爆炸事件的真相（後篇）◆
152（162） 神秘老人失蹤事件◆
153（163） 園子危險的夏日物語（前篇）
154（164） 園子危險的夏日物語（後篇）
155（165） 水中鑰匙密室事件◆
156（166） 本廳刑事戀愛物語2（前篇）
157（167） 本廳刑事戀愛物語2（後篇）
158（168） 沉默的環狀線◆
159（169） 詭異的五重塔
1996年（1~42）
1 雲霄飛車殺人事件 B/S
2 董事長千金綁架事件
3 偶像密室殺人事件
4 大都會暗號地圖事件
5 新幹線大爆破事件
6 情人節殺人事件◆
7 每月一件禮物恐嚇事件
8 美術館殺人事件
9 天下第一夜祭殺人事件
10 足球選手恐嚇事件
12（13） 步美被綁架事件
13（14） 奇怪的尋親殺人事件
14（15） 謎樣的訊息狙擊事件◆
15（16） 消失的屍體殺人事件
16（17） 古董收藏家殺人事件
17（18） 百貨公司挾持事件◆
18（19） 六月新娘殺人事件
19（20） 電梯殺人事件◆
20（21） 鬼屋殺人事件
21（22） 電視臺外景隊殺人事件◆
22（23） 豪華客輪連續殺人事件（前篇）
23（24） 豪華客輪連續殺人事件（後篇）
24（25） 喪失記憶的美女事件◆
25（26） 真假人質綁票事件◆
26（27） 愛犬約翰殺人事件◆
27（28） 小五郎同學會殺人事件（前篇）
28（29） 小五郎同學會殺人事件（後篇）
29（30） 計算機殺人事件◆
30（31） 不在場證明殺人事件◆
31（32） 電視臺殺人事件
32（33） 咖啡廳殺人事件
33（34） 偵探團生還事件◆
34（35） 山莊繃帶怪人殺人事件（前篇）
35（36） 山莊繃帶怪人殺人事件（後篇）
36（37） 星期一晚上7:30殺人事件◆
37（38） 仙人掌花殺人事件◆
38（39） 赤鬼村火祭殺人事件
39（40） 企業家千金殺人事件（前篇）
40（41） 企業家千金殺人事件（後篇）
41（42） 優勝錦旗被割事件◆
42（43） 卡拉OK廳殺人事件
1997年（43~85）
43（44） 江戶川柯南誘拐事件
44（45） 堀田三兄弟殺人事件◆
45（46） 敷面膜殺人事件◆
46（47） 雪山山莊殺人事件
47（48） 健身俱樂部殺人事件◆
48（49） 外交官殺人事件（前篇） X
49（50） 外交官殺人事件（後篇） S/X
50（51） 圖書館殺人事件
51（52） Golf練習場殺人事件◆
53（55） 神秘兇器殺人事件◆
54（56） 電玩公司殺人事件 B
55（57） 列車手法殺人事件◆
56（58） 清潔車殺人事件◆
57（59） 福爾摩斯迷殺人事件（前篇） X
58（60） 福爾摩斯迷殺人事件（後篇） X
59（61） 首次購物殺人事件◆
60（62） 插畫畫家殺人事件
61（63） 幽靈船殺人事件（前篇）◆
62（64） 幽靈船殺人事件（後篇）◆
63（65） 大怪獸哥梅拉殺人事件
64（66） 第三個指紋殺人事件◆
65（67） 螃蟹和鯨魚綁架事件◆
66（68） 夜路殺人事件◆
67（69） 舞臺女演員殺人事件◆
68（70） 暗夜男爵殺人事件（事件篇）
69（71） 暗夜男爵殺人事件（疑惑篇）
70（72） 暗夜男爵殺人事件（解決篇）
71（73） 米花之狼殺人事件◆
72（74） 三胞胎別墅殺人事件
73（75） 少年偵探隊遇難事件◆
74（76） 死神陣內殺人事件◆
75（77） 金融公司社長殺人事件
77（80） 名門連續慘死事件（前篇） X
78（81） 名門連續慘死事件（後篇） X
79（82） 銀行強盜殺人事件◆
80（83） 流浪畫家殺人事件◆
81（84） 當紅歌星綁架事件（前篇）
82（85） 當紅歌星綁架事件（後篇）
83（86） 綜合醫院殺人事件◆
84（87） 滑雪別墅殺人事件（前篇）
85（88） 滑雪別墅殺人事件（後篇）
1998年（86~128）
86（89） 誘拐現場特定事件◆（注：該集根據漫畫《名偵探柯南特別篇》第1卷改編，並非青山剛昌的原作）
87（90） 白鶴報恩殺人事件◆
88（91） 德休拉別墅殺人事件（前篇）◆
89（92） 德休拉別墅殺人事件（後篇）◆
90（93） 花香殺人事件◆
91（94） 搶匪住院事件
92（95） 恐怖登山殺人事件（前篇）◆
93（96） 恐怖登山殺人事件（後篇）◆
94（97） 雪女傳說殺人事件◆
95（98） 小五郎約會殺人事件◆
97（103） 離別美酒殺人事件◆
98（104） 名陶藝家殺人事件（前篇）
99（105） 名陶藝家殺人事件（後篇）
100（106） 初戀情人回憶事件（前篇）
101（107） 初戀情人回憶事件（後篇）
102（108） 古裝演員殺人事件（前篇）
103（109） 古裝演員殺人事件（後篇）
104（110） 盜賊集團別墅事件（前篇）
105（111） 盜賊集團別墅事件（後篇）
106（112） 新聞照片殺人事件◆
107（113） 鼴鼠星人之謎事件（前篇）◆
108（114） 鼴鼠星人之謎事件（後篇）◆
109（115） 偵探團大追擊事件◆
110（116） 烹飪教室殺人事件（前篇）◆
111（117） 烹飪教室殺人事件（後篇）◆
112（118） 帝丹小學七大離奇事件
113（119） 白色海灘殺人事件◆（注：該集根據漫畫《名偵探柯南特別篇》第1卷改編，並非青山剛昌的原作）
114（120） 有氧潛水殺人事件（前篇）
115（121） 有氧潛水殺人事件（後篇）
116（122） 推理小說家失蹤事件（前篇）
117（123） 推理小說家失蹤事件（後篇） X
119（126） 假面超人殺人事件◆
120（127） 蜜蜂雞尾酒殺人事件◆
121（128） 浴室密室事件（前篇）
122（129） 浴室密室事件（後篇）
123（130） 天氣預報小姐綁架事件◆
124（131） 神秘的狙擊者殺人事件（前篇）◆
125（132） 神秘的狙擊者殺人事件（後篇）◆
126（133） 旅行劇團殺人事件（前篇）◆
127（134） 旅行劇團殺人事件（後篇）◆
1999年（129~173）
130（140） 競技場無差別脅迫事件（前篇）
131（141） 競技場無差別脅迫事件（後篇）
132（142） 魔術愛好者殺人事件（事件篇） K
133（143） 魔術愛好者殺人事件（疑惑篇） K
134（144） 魔術愛好者殺人事件（解決篇） K
135（145） 消失的兇器搜尋事件◆
136（146） 藍色古堡探索事件（前篇）
137（147） 藍色古堡探索事件（後篇）
138（148） 最終播映殺人事件（前篇）
139（149） 最終播映殺人事件（後篇）
140（150） SOS！步美傳達的訊息◆
141（151） 結婚前夕密室事件（前篇） X
142（152） 結婚前夕密室事件（後篇） X
143（153） 疑惑的天體觀測◆
144（154） 上野出發的北斗星3號（前篇）
145（155） 上野出發的北斗星3號（後篇）
146（156） 本廳刑事戀愛物語（前篇）
147（157） 本廳刑事戀愛物語（後篇）
148（158） 路上電車緊急剎車事件◆
149（159） 遊樂園高空彈跳事件◆
150（160） 汽車爆炸事件的真相（前篇）◆
151（161） 汽車爆炸事件的真相（後篇）◆
152（162） 神秘老人失蹤事件◆
153（163） 園子危險的夏日物語（前篇）
154（164） 園子危險的夏日物語（後篇）
155（165） 水中鑰匙密室事件◆
156（166） 本廳刑事戀愛物語2（前篇）
157（167） 本廳刑事戀愛物語2（後篇）
158（168） 沉默的環狀線◆
159（169） 詭異的五重塔