‘浣熊市’是全球最強大的科技集團‘安布雷拉公司’的總部所在地，公司自從‘蜂巢’在三十天前失去聯絡後，派一個小隊前去驚天解密的蜂巢檢視，但卻永遠開啟了浣熊市的死亡喪鐘。蜂巢的開啟使得裡面的感染者全部逃出；
公司得知訊息後立刻將住在浣熊市內的公司重要人物移送出城，其中包括公司六級科學家查爾斯•阿什福德，以及他的女兒安琪拉•阿什福德，後來所有的重要人物全部移送出城，但移送安琪拉的車卻遭遇車禍而失去聯絡。
十三小時後，浣熊市變成一片充滿暴力衝突的城市，大部分流浪漢首先成為感染者的受害者，被警方逮捕後依然對警察攻擊，但一名停職中及瞭解生化病毒的‘S.T.A.R.S.’女警吉爾•華倫泰射殺來到警局後對所有警員透露了感染者的弱點。
之後安布雷拉公司下令疏散整座城市，而所有市民聽到訊息後全部前往城市疏散點的大橋撤離，安布雷拉公司的軍官少校提摩西•凱恩開啟了‘復仇邪神計劃’，此時在浣熊市安布雷拉市立醫院裡，蜂巢昔日的倖存者艾莉絲從病房醒來，走出醫院後看到一片狼藉，於是拿起散彈槍走進被感染的城市。
兩小時後，浣熊市已經變成一座血腥死亡之城，大部分被撤回城市的市民全部變成了嗜血感染者，浣熊市警察和S.T.A.R.S.特種部隊在全軍出動下盡全力反抗，但卻不知感染者的弱點而被一個一個吃掉，最後除了以卡洛斯•奧利維拉領導的安布雷拉僱傭兵小隊逃離以外，其他所有的警察和特種部隊全軍覆沒。
閘門外，查爾斯因為不想遺棄自己的女兒而決定留下，在帳篷裡利用解碼程式進入浣熊市的保全系統，也發現自己的女兒還藏在學校，於是決定搜尋倖存者來幫忙找他的女兒。艾莉絲離開醫院後進入一家槍店拿了武器和衣服，但也因為身體被做過病毒實驗而痛苦不堪。吉爾、佩頓以及浣熊市新聞臺女主播泰莉躲藏在浣熊市教堂，卻意外遇到從蜂巢裡逃出來的“舔食者”，但艾莉絲的突然趕到而拯救了所有人。
後來，普通市民L.J.躲進一家酒吧時得到藏在酒吧裡的S.T.A.R.S.成員的幫助，卻意外遇到離開醫院的復仇邪神，手上拿著五千子彈的小型機槍以及毒刺導彈，一下解決所有S.T.A.R.S.成員，卻在離開時放走L.J.。艾莉絲等人在大樓前接到查爾斯的電話，而查爾斯決定利用以自己女兒的救援去跟艾莉絲換離開城市的方法，也向艾莉絲說明安布雷拉公司發現任何措施都回天乏術下；
決定在日出時發射一枚五千噸TNT當量的核彈將浣熊市全部摧毀，剛好銷燬所有生化病毒武器的證據，最後以核電站洩漏的理由去欺騙媒體大眾！眾人無法接受安布雷拉的殘酷後決定接受查爾斯提供的救援計劃，但在前往學校時遭到復仇邪神的攻擊，佩頓死於亂槍之中。凱恩與安布雷拉的眾人從復仇邪神看到艾莉絲後將邪神的攻擊力提升到最高，艾莉絲也以最高火力跟邪神對打，也為了躲火箭炮而進入警察局的垃圾投棄口逃脫。
卡洛斯與尼可萊逃出醫院後整理了咬傷，但也接到了查爾斯的電話，同樣以救援換取逃離。吉爾與泰莉在去學校前遇到L.J.，而L.J.也加入吉爾的行列，眾人到學校後決定單獨行動。L.J.在化學教室搜尋時遇到感染者但卻被趕到的卡洛斯搭救，卡洛斯說明他也跟查爾斯達成協議而搜尋安琪拉。
艾莉絲與安琪拉相遇時互相表面自己曾經見過，而安琪拉也對眾人說出事實：自己的父親查爾斯竟然就是T病毒與G病毒的創始人，目的就是為了拯救小時殘疾的安琪拉，但成果卻被安布雷拉公司奪走。 眾人與卡洛斯相遇後離開學校前再次接到查爾斯的電話，查爾斯告知艾莉絲關於浣熊市的最後出路：停在浣熊市政廳的直升機。但查爾斯還沒交代完就被進來的凱恩發現，而凱恩也將查爾斯押入直升機前往市政廳。
艾莉絲與等人前往市政廳的途中為卡洛斯注射解藥，而吉爾也為了保留證據而利用泰莉的攝影機叫艾莉絲將所有的事實錄影，而眾人到達市政廳後發現直升機已到達平臺，艾莉絲在解決頂樓和平臺上的守衛後，進入直升機時突然想起自己其實被注射了T病毒，而為自己注射的人就是凱恩。
而此時復仇邪神突然出現在平臺上，眾人亦被隱藏的安布雷拉部隊截獲。艾莉絲在走出直升機後遇見凱恩與查爾斯，但凱恩卻命令艾莉絲與復仇邪神對打，順便測試T病毒在不同實驗物件的作用，但艾莉絲拒絕，於是凱恩將查爾斯開槍打死，而安琪拉也對於父親之死而對凱恩恨入之骨，艾莉絲也在良心下決定對打。
艾莉絲空手對抗復仇邪神時發現邪神的實驗物件竟然是昔日一起逃出蜂巢的麥特，因此在最後無法下手，凱恩在放棄下命令邪神處決艾莉絲，但邪神卻將艾莉絲身旁的守衛全部打死，並繼續掩護艾莉絲等人。而卡洛斯等人也解開手銬而繼續作戰，而凱恩卻下令發射核彈，但在上飛機時被坐在駕駛座的L.J.埋伏。
眾人成功逃離市政廳後準備接受核彈衝擊，而核彈也直接飛到市政廳上空後引爆，將浣熊市炸成碎片，而直升機接受衝擊時直接墜落到郊區。三小時後，安布雷拉公司一級科學家艾薩克領隊到達直升機墜毀的現場，並回收瀕臨死亡的艾莉絲。
不久，全世界的新聞都在瘋狂播報浣熊市的毀滅，而安布雷拉公司亦如Alice之前所說捏造了一個核電站洩漏意外引發核爆的故事來掩蓋事實真相。雖然吉爾最終將裝滿證據的攝影機公諸於世，但卻被認為太過於浮誇而為世人視為謬論。
三個星期後，安布雷拉公司底特律總部，艾薩克與眾人將艾莉絲的身體修復，而艾莉絲清醒後卻忘記了所有的事情，但卻在最後對艾薩克說了自己的名字及記得所有事情，於是立刻將總部的守衛直接打倒，也在出去時遇到保安的攔截。
但此時，以安布雷拉公司高階部門人員出現的吉爾、卡洛斯、L.J.及安琪拉突然出現，將艾莉絲直接帶走。但艾薩克卻安然讓艾莉絲離開。 在故事尾聲也揭開艾薩克的目的－艾莉絲計劃。
‘浣熊市’是全球最強大的科技集團‘安布雷拉公司’的總部所在地，公司自從‘蜂巢’在三十天前失去聯絡後，派一個小隊前去驚天解密的蜂巢檢視，但卻永遠開啟了浣熊市的死亡喪鐘。蜂巢的開啟使得裡面的感染者全部逃出；
公司得知訊息後立刻將住在浣熊市內的公司重要人物移送出城，其中包括公司六級科學家查爾斯•阿什福德，以及他的女兒安琪拉•阿什福德，後來所有的重要人物全部移送出城，但移送安琪拉的車卻遭遇車禍而失去聯絡。
十三小時後，浣熊市變成一片充滿暴力衝突的城市，大部分流浪漢首先成為感染者的受害者，被警方逮捕後依然對警察攻擊，但一名停職中及瞭解生化病毒的‘S.T.A.R.S.’女警吉爾•華倫泰射殺來到警局後對所有警員透露了感染者的弱點。
之後安布雷拉公司下令疏散整座城市，而所有市民聽到訊息後全部前往城市疏散點的大橋撤離，安布雷拉公司的軍官少校提摩西•凱恩開啟了‘復仇邪神計劃’，此時在浣熊市安布雷拉市立醫院裡，蜂巢昔日的倖存者艾莉絲從病房醒來，走出醫院後看到一片狼藉，於是拿起散彈槍走進被感染的城市。
兩小時後，浣熊市已經變成一座血腥死亡之城，大部分被撤回城市的市民全部變成了嗜血感染者，浣熊市警察和S.T.A.R.S.特種部隊在全軍出動下盡全力反抗，但卻不知感染者的弱點而被一個一個吃掉，最後除了以卡洛斯•奧利維拉領導的安布雷拉僱傭兵小隊逃離以外，其他所有的警察和特種部隊全軍覆沒。
閘門外，查爾斯因為不想遺棄自己的女兒而決定留下，在帳篷裡利用解碼程式進入浣熊市的保全系統，也發現自己的女兒還藏在學校，於是決定搜尋倖存者來幫忙找他的女兒。艾莉絲離開醫院後進入一家槍店拿了武器和衣服，但也因為身體被做過病毒實驗而痛苦不堪。吉爾、佩頓以及浣熊市新聞臺女主播泰莉躲藏在浣熊市教堂，卻意外遇到從蜂巢裡逃出來的“舔食者”，但艾莉絲的突然趕到而拯救了所有人。
後來，普通市民L.J.躲進一家酒吧時得到藏在酒吧裡的S.T.A.R.S.成員的幫助，卻意外遇到離開醫院的復仇邪神，手上拿著五千子彈的小型機槍以及毒刺導彈，一下解決所有S.T.A.R.S.成員，卻在離開時放走L.J.。艾莉絲等人在大樓前接到查爾斯的電話，而查爾斯決定利用以自己女兒的救援去跟艾莉絲換離開城市的方法，也向艾莉絲說明安布雷拉公司發現任何措施都回天乏術下；
決定在日出時發射一枚五千噸TNT當量的核彈將浣熊市全部摧毀，剛好銷燬所有生化病毒武器的證據，最後以核電站洩漏的理由去欺騙媒體大眾！眾人無法接受安布雷拉的殘酷後決定接受查爾斯提供的救援計劃，但在前往學校時遭到復仇邪神的攻擊，佩頓死於亂槍之中。凱恩與安布雷拉的眾人從復仇邪神看到艾莉絲後將邪神的攻擊力提升到最高，艾莉絲也以最高火力跟邪神對打，也為了躲火箭炮而進入警察局的垃圾投棄口逃脫。
卡洛斯與尼可萊逃出醫院後整理了咬傷，但也接到了查爾斯的電話，同樣以救援換取逃離。吉爾與泰莉在去學校前遇到L.J.，而L.J.也加入吉爾的行列，眾人到學校後決定單獨行動。L.J.在化學教室搜尋時遇到感染者但卻被趕到的卡洛斯搭救，卡洛斯說明他也跟查爾斯達成協議而搜尋安琪拉。
艾莉絲與安琪拉相遇時互相表面自己曾經見過，而安琪拉也對眾人說出事實：自己的父親查爾斯竟然就是T病毒與G病毒的創始人，目的就是為了拯救小時殘疾的安琪拉，但成果卻被安布雷拉公司奪走。 眾人與卡洛斯相遇後離開學校前再次接到查爾斯的電話，查爾斯告知艾莉絲關於浣熊市的最後出路：停在浣熊市政廳的直升機。但查爾斯還沒交代完就被進來的凱恩發現，而凱恩也將查爾斯押入直升機前往市政廳。
艾莉絲與等人前往市政廳的途中為卡洛斯注射解藥，而吉爾也為了保留證據而利用泰莉的攝影機叫艾莉絲將所有的事實錄影，而眾人到達市政廳後發現直升機已到達平臺，艾莉絲在解決頂樓和平臺上的守衛後，進入直升機時突然想起自己其實被注射了T病毒，而為自己注射的人就是凱恩。
而此時復仇邪神突然出現在平臺上，眾人亦被隱藏的安布雷拉部隊截獲。艾莉絲在走出直升機後遇見凱恩與查爾斯，但凱恩卻命令艾莉絲與復仇邪神對打，順便測試T病毒在不同實驗物件的作用，但艾莉絲拒絕，於是凱恩將查爾斯開槍打死，而安琪拉也對於父親之死而對凱恩恨入之骨，艾莉絲也在良心下決定對打。
艾莉絲空手對抗復仇邪神時發現邪神的實驗物件竟然是昔日一起逃出蜂巢的麥特，因此在最後無法下手，凱恩在放棄下命令邪神處決艾莉絲，但邪神卻將艾莉絲身旁的守衛全部打死，並繼續掩護艾莉絲等人。而卡洛斯等人也解開手銬而繼續作戰，而凱恩卻下令發射核彈，但在上飛機時被坐在駕駛座的L.J.埋伏。
眾人成功逃離市政廳後準備接受核彈衝擊，而核彈也直接飛到市政廳上空後引爆，將浣熊市炸成碎片，而直升機接受衝擊時直接墜落到郊區。三小時後，安布雷拉公司一級科學家艾薩克領隊到達直升機墜毀的現場，並回收瀕臨死亡的艾莉絲。
不久，全世界的新聞都在瘋狂播報浣熊市的毀滅，而安布雷拉公司亦如Alice之前所說捏造了一個核電站洩漏意外引發核爆的故事來掩蓋事實真相。雖然吉爾最終將裝滿證據的攝影機公諸於世，但卻被認為太過於浮誇而為世人視為謬論。
三個星期後，安布雷拉公司底特律總部，艾薩克與眾人將艾莉絲的身體修復，而艾莉絲清醒後卻忘記了所有的事情，但卻在最後對艾薩克說了自己的名字及記得所有事情，於是立刻將總部的守衛直接打倒，也在出去時遇到保安的攔截。
但此時，以安布雷拉公司高階部門人員出現的吉爾、卡洛斯、L.J.及安琪拉突然出現，將艾莉絲直接帶走。但艾薩克卻安然讓艾莉絲離開。 在故事尾聲也揭開艾薩克的目的－艾莉絲計劃。