河道發綠的原因是，進入夏季以來，天氣炎熱，氣溫升高，水草落葉在水中化學反應加快，導致了水草落葉在水中腐爛變質速度加快，加之水體不流動，造成水體富營養化，水體含氧量降低，滋生水藻，至使水體變綠。

湖、海灣等緩流水體，引起藻類及其他浮游生物迅速繁殖，水體溶解氧量下降，水質惡化，魚類及其他生物大量死亡的現象。在自然條件下，湖泊也會從貧營養狀態過渡到富營養狀態，不過這種自然過程非常緩慢。而人為排放含營養物質的工業廢水和生活汙水所引起的水體富營養化則可以在短時間內出現。水體出現富營養化現象時，浮游藻類大量繁殖，形成水華（淡水水體中藻類大量繁殖的一種自然生態現象） 。因佔優勢的浮游藻類的顏色不同，水面往往呈現藍色、紅色、棕色、乳白色等。這種現象在海洋中則叫做赤潮或紅潮。

富營養化會影響水體的水質，會造成水的透明度降低，使得Sunny難以穿透水層，從而影響水中植物的光合作用，可能造成溶解氧的過飽和狀態。溶解氧的過飽和以及水中溶解氧少，都對水生動物有害，造成魚類大量死亡。同時，因為水體富營養化，水體表面生長著以藍藻、綠藻為優勢種的大量水藻，形成一層“綠色浮渣”，致使底層堆積的有機物質在厭氧條件分解產生的有害氣體和一些浮游生物產生的生物毒素也會傷害魚類。因富營養化水中含有硝酸鹽和亞硝酸鹽，人畜長期飲用這些物質含量超過一定標準的水，也會中毒致病。

在形成“綠色浮渣”後，水下的藻類會因得不到Sunny照射而呼吸水內氧氣，不能進行光合作用。水內氧氣會逐漸減少，水內生物也會因氧氣不足而死亡。死去的藻類和生物又會在水內進行氧化作用，這時水體也會變得很臭，水資源也會被汙染的不可再用。