概括起來講，番茄嫁接育苗應注意以下幾個問題：

（1）要較常規育苗法提早播種育苗的時間由於嫁接苗嫁接初期需要8～10天的成活時間，而此期的番茄苗生長很慢，育苗時間也相應地加長，因此嫁接育苗的播種期應適當提早8～10天。（2）要調接好番茄和砧木的播種時間不同嫁接方法對番茄和砧木的播種時間要求情況，前面已有介紹，這裡主要強調的是如果番茄苗嫁接前不進行移栽，而只是砧木苗移栽情況下，要考慮到砧木苗移栽後，由於苗子需要幾天的緩苗時間，故在砧木的具體播種時間安排上，還要再加上一週左右的緩苗時間。（3）苗莖的切口部位要正確為避免嫁接後，番茄苗和砧木苗間的葉片互相擠碰，降低介面的接合質量，切口時，番茄苗和砧木苗均要在不著生葉子的苗莖一側切口。

（4）要注意保護嫁接苗的介面，避免發生劈裂或折斷現象。（5）要確保砧木苗和番茄苗的共生質量番茄苗和砧木苗只有完全共生，才能互相促進，互相利用。一旦番茄苗莖上生出自根，且根扎入地裡後，由於受親緣關係的影響，番茄苗穗製造的營養，將會優先供應自根，從而不利於砧木根系的正常生長，同時也將會導致嫁接失去意義。反過來講，如果砧木苗莖上發出了側枝，由於親緣關係的原因，砧木根系吸收的水和肥也將是優先供應給自己的側枝，從而抑制番茄苗穗的正常生長。所以，一旦發現番茄苗穗上長出不定根或砧木苗莖上長出側枝後，要及早抹掉。