根本原因是指導致事物發生變化的根源或者導致事物發生變化的最本質的原因。

直接原因是指對事物的發生發展起到最直接的推動，並直接促成其發生變化的原因，不經過中間事物和中介環節。

根本原因和直接原因的區別是：

1、兩者的著眼點不同，一個更加深入，一個相對淺顯。

2、一個很宏觀，一更加微觀。

根本原因和直接原因的區別舉例說明：

以陳勝吳廣起義為例子，直接原因是大雨，可能會遲到。遲到要殺頭，所以造反了。也就是說，沒有那場大雨，也許暫時還不會有陳勝吳廣的農民起義。根本原因是秦朝嚴苛的制度，即使沒有那場雨，即使沒有陳勝吳廣，也會有下一場雨，下一個張勝某廣，因為別的原因進行起義。

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根本原因分析法最常見的一項內容是，提問為什麼會發生當前情況， 並對可能的答案進行記錄。 然而，再逐一對每個答案為一個為什麼，並記錄下原因。

根本原因分析法的目的就是要努力找出問題的作用因素，並對所有的原因進行分析。這種方法透過反覆問一個為什麼，能夠把問題逐漸引向深入，直到你發現根本原因。

找到根本原因後，就要進行下一個步驟： 評估改變根本原因的最佳方法，從而從根本上解決問題。 這是另一個獨立的過程，一般被稱之為 改正和預防。

當我們在尋找根本原因的時候，必須要記住對每一個已找出的原因也要進行評估，給出改正的辦法，因為這樣做也將有助於整體改善和提高。