以下提供幾個常用的方法來去除過多的藻：

物理清除法：

簡單的說就是拿刷子刷，水族店什麼都有賣，同時並用換水，效果顯著。缺點是不徹底，有些角落不易清除。

化學清除法：

使用除藻劑。優點是對任何藻類都有效，且可有效清除附著在水草、沉木等不易清除地方的藻類。缺點是依據品質不同對魚和生態平衡有一定程度的衝擊。

生物清除法：

使用除藻動物來控制藻類的數量，效果為三種中所花費時間較長，但最安全也最省力的方式。以下介紹幾種常用的除藻生物。

1.笠螺：除藻動物首推笠螺，功能大概跟磁鐵刷差不多強大。縱橫魚缸，天下無敵，連外掛過濾進水口都可以爬進去清。耐藥性耐鹽性極低，但因其除藻能力超強，仍居除藻生物首位。

2.蘋果螺：除藻能力弱，且便便極多，但優點是容易繁殖，可以數量取勝，價格：隨便網路上要都有。

3.清苔鼠、黃金清苔鼠：吸壁魚類的一種，為清藻魚類中第二大的，可長到10~15cm長，且經過多位魚友證實，只要有飼料餵的夠多，清苔鼠會去搶食飼料，而且久了之後會有慣性，從此只會等飼料，不會清藻類，所以並不建議使用清苔鼠。

4.黑殼蝦：除藻功能普通，推薦使用於草缸處理腐敗之葉片，對於小細縫及葉片上的藻類有意想不到的功能，能在水族箱中繁衍，但有帶菌的問題。

5.大和藻蝦：除藻功能與黑殼蝦差不多，體型較黑殼蝦大隻。