1、NTFS提供長檔名，壓縮分割槽，事件跟蹤，檔案索引，高容錯，資料保護和恢復以及加密訪問。exFAT檔案系統不能。

　　2、NTFS檔案系統格式僅適用於Microsoft計算機作業系統。 它不適用於Apple作業系統; exFAT檔案系統格式適用於Microsoft計算機作業系統和Apple作業系統。

　　3、exFAT訪問速度將根據檔案減少到不同程度，exFAT支援各種可移動儲存卡和快閃記憶體驅動器。

　　4、exFAT檔案是Microsoft建立的一種新檔案格式，用於替換FAT32檔案格式。 它可以支援高達1EB的檔案大小，非常適合儲存大檔案，並且可以在Mac和Windows作業系統上使用。

NTFS對快閃記憶體壽命影響比較大，隨身碟格式化為exFAT之後存取速度會大幅降低，並影響使用壽命。 區別

1、適用範圍不同 exFAT：適合於快閃記憶體盤（隨身碟）。 NTFS：適合於磁碟（機械硬碟、固態硬碟）。

2、支援最大空間不同 exFAT：最大支援16EB（目前256GB）。 NTFS：最大支援256TB（MBR）。

3、安全性不同 exFAT：微軟專為快閃記憶體（隨身碟、儲存卡）快閃記憶體裝置設計的檔案系統，相容性好。 NTFS：安全性和易用性、穩定性好。

4、隨身碟使用壽命不同 exFAT：隨身碟等移動裝置首選，使用壽命長。 NTFS：隨身碟不建議使用NTFS，會大幅度縮短壽命。

5、使用系統不同 exFAT：Windows與Mac均可適用。 NTFS：對於Mac使用者不能直接使用，MAC使用者需要藉助第三方軟體才可以寫入NTFS檔案系統。