1）紫外線照射法，採用的紫外線燈管隨使用時間的增加而減退，因此殺菌能力不斷減退；紫外線穿透力極弱，有死角，殺菌作用隨著菌種不同而不同。燈管壽命短，執行費用高。
2）氯氣在殺死細菌的同時卻與尿素、有機物形成氯化胺及三滷甲烷(THM),而THM可能導致肺、肝及中樞神經系統的癌變。
3）在空氣中，臭氧快速自然分解氧氣的特性，是臭氧用作消毒滅菌劑的獨有特點。臭氧氧化滅菌過程中“多餘的氧原子會自行重新結合成為普通氧分子（02），不存任何有毒殘留物。如果用高濃度臭氧水消毒食物則不宜，因為缺少可靠的檢測以確定不會產生新的危害。
4）
次氯酸鈉消毒的機理主要是靠次氯酸鈉分解出氧原子，因為氧原子有非常強的氧化性，與其它有毒物質發生化學反應，再生成無毒或毒性較小的物質，這對生物病毒或有機分子有毒物質效果比較明顯，而對於重金屬離子類的有毒物質的消毒效果就微乎其微了。
從消毒裝置的發展趨勢上看，選擇一種更好的無毒無汙染的方式更為理想化，所以臭氧消毒最效果理想。但每一種消毒劑不可能沒有利弊的。從消毒能力上講，臭氧和次氯酸鈉都很好，但臭氧稍比次氯酸鈉滅菌更快速一些，水質方面也沒有太多的異味物質生成，不過作為液體的次氯酸鈉又比臭氧更好管理一些，水質也能夠充分保障達標。就裝置所佔空間大小來說兩者都相差無幾，只是次氯酸鈉發生器比臭氧發生器多需要一兩三平方米儲存食鹽的地方。從投資到裝置使用來考慮，次氯酸鈉發生器消毒就比臭氧更具有優勢，投資較臭氧少得多，僅是臭氧的五分之一，裝置執行更加穩定。採用次氯酸鈉消毒的執行成本費稍比氯氣高一些。根據英國所統計的一組資料表明，次氯酸鈉同氯氣成本相比大約為1.05 ：1。
1）紫外線照射法，採用的紫外線燈管隨使用時間的增加而減退，因此殺菌能力不斷減退；紫外線穿透力極弱，有死角，殺菌作用隨著菌種不同而不同。燈管壽命短，執行費用高。
2）氯氣在殺死細菌的同時卻與尿素、有機物形成氯化胺及三滷甲烷(THM),而THM可能導致肺、肝及中樞神經系統的癌變。
3）在空氣中，臭氧快速自然分解氧氣的特性，是臭氧用作消毒滅菌劑的獨有特點。臭氧氧化滅菌過程中“多餘的氧原子會自行重新結合成為普通氧分子（02），不存任何有毒殘留物。如果用高濃度臭氧水消毒食物則不宜，因為缺少可靠的檢測以確定不會產生新的危害。
4）
次氯酸鈉消毒的機理主要是靠次氯酸鈉分解出氧原子，因為氧原子有非常強的氧化性，與其它有毒物質發生化學反應，再生成無毒或毒性較小的物質，這對生物病毒或有機分子有毒物質效果比較明顯，而對於重金屬離子類的有毒物質的消毒效果就微乎其微了。
從消毒裝置的發展趨勢上看，選擇一種更好的無毒無汙染的方式更為理想化，所以臭氧消毒最效果理想。但每一種消毒劑不可能沒有利弊的。從消毒能力上講，臭氧和次氯酸鈉都很好，但臭氧稍比次氯酸鈉滅菌更快速一些，水質方面也沒有太多的異味物質生成，不過作為液體的次氯酸鈉又比臭氧更好管理一些，水質也能夠充分保障達標。就裝置所佔空間大小來說兩者都相差無幾，只是次氯酸鈉發生器比臭氧發生器多需要一兩三平方米儲存食鹽的地方。從投資到裝置使用來考慮，次氯酸鈉發生器消毒就比臭氧更具有優勢，投資較臭氧少得多，僅是臭氧的五分之一，裝置執行更加穩定。採用次氯酸鈉消毒的執行成本費稍比氯氣高一些。根據英國所統計的一組資料表明，次氯酸鈉同氯氣成本相比大約為1.05 ：1。