艾灸對治療一些疾病有著很明顯的療效，深受廣大群眾的喜愛，但凡一種治療方法都有一定的適應症和禁止症，在做艾灸時，要充分了解。艾灸的副作用有，如果操作不當，會導致灼傷面板，產生水泡，引起感染，或出現疤痕，影響美現；有部分人艾灸後會出現面板過敏，面板瘙癢的症狀；有的人會出現身體上火的現象，如口舌生瘡，出現口腔潰瘍；還有部分人艾灸時會出現頭暈、噁心、出冷汗、胸悶、心跳加速等不適症狀，這種情況要立即停止艾灸，平躺休息，可以喝一些溫開水，注意觀察情況，嚴重的話要馬上送醫院進行處理。所以艾灸要掌握好適應症，一些有面板病的、體質虛弱的、月經期的女性、孕婦等人群不適合艾灸。

艾灸的主要作用是溫經散寒的作用的，用於陽虛不能溫養四肢血脈引起的疼痛，或者體寒，胃寒的治療的，由於主要是溫性的作用，所以對於內熱大引起的情況是禁用的。如果要說副作用，主要是傷陰，由於溫熱的灸法，主要是火熱溫經，所以會出現傷陰的情況的，其次，對於素體內熱的體質的話，可能會引起陽熱更盛的情況的，所以需要辯證施灸。