大多數的牙齦萎縮都是由牙周病引起的病理性萎縮。

牙周炎引起牙齦萎縮，主要是因為區域性菌斑和牙結石長期刺激牙周組織產生炎症，造成牙槽骨的吸收，附著在牙槽骨上的牙齦也就隨著向牙根方向萎縮。

而且一旦發生牙槽骨吸收和牙齦萎縮，就會直接威脅到牙齒的牢固和生命的根基，牙齒的牙周支援力減弱，進而造成牙齒鬆動、移位甚至脫落。

牙齦萎縮之後一般是不可逆的，因為被破壞的牙齦組織不會重新生長，現有的治療方法只能在沒有進一步加重萎縮的情況下進行控制，所以無法恢復。

由牙周炎引起的牙齦萎縮，需要透過牙周基礎治療齦上潔治、齦下刮治來去除區域性菌斑、牙結石刺激物，為牙齦提供一個健康的環境，輕微的牙齦萎縮治療後可能會恢復正常。

牙齦萎縮後，牙縫更容易嵌塞食物引發炎症，所以更需要注意口腔衛生護理。掌握正確的刷牙方法。配合使用漱口液、牙縫刷、牙線以清理牙刷難以徹底清潔的角落；避免使用牙籤，因為長期使用牙籤剔牙容易刺激牙間隙處牙齦頭的萎縮。