造成宮外孕的原因主要是輸卵管功能問題和宮腔環境、內膜容受性等因素。95%是因為輸卵管功能問題而導致：

1、輸卵管炎症或感染：炎症感染導致輸卵管粘連、通而不暢等問題，小蝌蚪能順利透過，形成受精卵後變大而無法透過狹窄的輸卵管回到宮腔；輸卵管蠕動減弱，無法將受精卵順利送回宮腔內著床；就會造成宮外孕。

2、輸卵管發育問題：有些病人的子宮輸卵管造影顯示其輸卵管特別狹長，正常輸卵管長度在8~15cm，輸卵管過長受精卵沒等游到宮口就著床了，也會形成宮外孕。

3、輸卵管肌層功能不好或纖毛損傷：如果輸卵管肌層發育不好，纖毛損傷，就會影響運送受精卵的動力，受精卵容易停留在輸卵管著床發育。

4、子宮內膜異位症：臨床發病率極高，異位的內膜很容易造成輸卵管粘連或阻塞通而不暢，阻礙受精卵正常著床發生宮外孕甚至不孕。

5、輸卵管周圍組織腫瘤：如果卵巢囊腫過大或者漿膜下子宮肌瘤過大，壓迫輸卵管，也會影響受精卵著床。

6、宮腔內環境不好，有炎性物質或內膜的容受性很差，內膜很貧瘠，也會出現不接納受精卵著床的現象，受精卵無處可去，也容易跑到宮角或者輸卵管去著床，從而造成宮外孕。

7、另外，避孕失敗也有可能會造成宮外孕。