胃鏡檢查可分為普通胃鏡檢查和無痛胃鏡檢查，還有比較少用主要用於篩查的膠囊內鏡。

目前做普通胃鏡檢查，因為用電子鏡，管子纖細柔軟，在插入至咽喉部時沒有原來纖維胃鏡那麼難受，但會有噁心憋氣等不適，插入胃內後可以有上腹部隱隱不適或輕微隱痛，一般都能忍受。普通胃鏡檢查前一般會做普通心電圖檢查20元和乙肝指標定性檢測40元，這裡共要支付60元錢左右。胃鏡檢查要200元，加上病理檢查費200∽300元右右。這樣總共約500元左右。不同的醫院等級收費略有高低差異。無痛胃鏡就是在做普通胃鏡檢查前，給病人上全麻藥，從病人的靜脈輸入。病人在無意識狀態下做胃鏡檢查。檢查過程中當然沒有不適感。清醒後會有頭暈及乏力感覺，那是全麻藥的反應，12小時後漸漸消失。無痛胃鏡在普通胃鏡的收費上再加上500元左右的麻醉費用。

膠囊內鏡沒有什麼痛苦，現在透過磁控可以檢查胃的各個角落，但易受胃粘液附著影響視野的清晰度，同時它不能做病理活檢。而且價格較高，一般在3000元左右。膠囊內鏡還可以檢查小腸，費用更貴，要4000∽8000元。