區別在於性質不同、獲取條件不同、適應範圍不同等等。

一、性質不同

工程師是參加工作後單位報人事部門評的一種專業技術職稱；二級建造師是建築類的一種執業資格，是擔任專案經理的前提條件。

二、獲取條件不同

工程師：本科參加工作一年即可成為助理工程師，不用考試；滿五年後就可以評工程師。

二級建造師：必須參加二級建造師考試，通過後才能成為二級建造師。二級建造師執業資格考試設《建設工程施工管理》、《建設工程法規及相關知識》和《專業工程管理與實務》3個科目。其中《專業工程管理與實務》科目分為：建築工程、公路工程、水利水電工程 、市政工程、礦業工程、機電工程6個專業類別，考生在報名時可根據實際工作需要選擇其一。

三、適應範圍不同

工程師適用於從事環境科研、監測、評價、規劃、工程設計、自然保護、技術資訊等工作的在職在崗工程技術人員。

二級建造師是以專業技術為依託、以工程專案管理為主的執業註冊人員，近期以施工管理為主。二級註冊建造師可以擔任二級建築業企業資質的建設工程專案施工的專案經理。大中型工程專案的專案經理必須逐步由取得建造師執業資格的人員擔任。