一般需要去推斷是否同染色體的肯定是雜合基因型,因為純和的推斷沒有意義。如果你是普通人做了基因檢測,那麼抱歉不能知道,而且機構也沒有義務給你去推算這個結果如果你是行業從業者,甚至是生信分析人員,那麼有些情況下有可能能算出來
首先看技術平臺,如果技術平臺不對,基本就沒辦法算了
1.基因分型晶片檢測的,沒法算,只有位點資訊,拉倒;
2.RT-PCR檢測,分型結果的資料肯定是看不出來的,但是你可以拿擴增產物去轉到細菌裡挑單克隆測。
3.一代測序,沒法看,測序結果是混合物的訊號,同樣可以考慮擴增產物的單克隆方式檢測;
4.二代測序:現在常用高通量測序讀長在200bp左右,我們以200bp為例
如果兩個位點之間的距離小於200bp,那麼透過原始reads可以找到支援是否共染色體的支援資料,很簡單;
如果兩個位點大於200bp,就要去做單體型分析看能不能利用兩者之間的多型位點跨過去,一般距離越大越難。
一般需要去推斷是否同染色體的肯定是雜合基因型,因為純和的推斷沒有意義。如果你是普通人做了基因檢測,那麼抱歉不能知道,而且機構也沒有義務給你去推算這個結果如果你是行業從業者,甚至是生信分析人員,那麼有些情況下有可能能算出來
首先看技術平臺,如果技術平臺不對,基本就沒辦法算了
1.基因分型晶片檢測的,沒法算,只有位點資訊,拉倒;
2.RT-PCR檢測,分型結果的資料肯定是看不出來的,但是你可以拿擴增產物去轉到細菌裡挑單克隆測。
3.一代測序,沒法看,測序結果是混合物的訊號,同樣可以考慮擴增產物的單克隆方式檢測;
4.二代測序:現在常用高通量測序讀長在200bp左右,我們以200bp為例
如果兩個位點之間的距離小於200bp,那麼透過原始reads可以找到支援是否共染色體的支援資料,很簡單;
如果兩個位點大於200bp,就要去做單體型分析看能不能利用兩者之間的多型位點跨過去,一般距離越大越難。