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  • 1 # 孟丹丹

    TCGA(The Cancer Genome Atlas, 癌症基因組圖譜)專案最早始於2005年,由美國政府出資,美國國家癌症研究所(National Cancer Institute)和美華人類基因組研究所(National Human Genome Research Institute)共同監督,旨在應用高通量的基因組分析技術,以幫助人們對癌症有個更好的認知,從而提高對於癌症的預防、診斷和治療能力。

    1.TCGA第一階段的測試專案,是以膠質母細胞瘤、肺癌和卵巢癌作為研究重點。

    2.其後的第二階段,計劃到2014年完成20-25種不同癌型的分析,而TCGA超額完成任務,已經收錄包括10種罕見癌型在內的33種類型的癌症。

    作為目前最大的癌症基因資訊資料庫,TCGA的全面不僅僅體現在眾多癌型上,還體現在多組學資料,包括基因表達資料、miRNA表達資料、複製數變異、DNA甲基化、SNP,而相對於GEO資料庫,小編覺得TCGA最大的優勢是豐富且規範的臨床資料,以及針對每種癌型的大樣本量。

    想要學習TCGA,這些涉及到的內容都要學習到。

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