有人認為百慕大海底有巨大的磁場，因此會造成羅盤失靈。1943年，一位名叫裘薩的博士曾在美國海軍配合下作了一次實驗，以兩臺磁力發生機輸出十幾櫚的磁力。磁力發生機開機後，船體周圍湧起綠色煙霧，船和人都受到了某種刺激，有些人經治療恢復正常，事後裘薩卻自殺而死。因此結果也就不了了之。

有人認為百慕大區域有著類似宇宙黑洞的現象。但“黑洞”是在太空中的一種狀態，在地球上否有黑洞，還有待於證明。有人認為百慕大海域海底有一股與海面潮流發生衝突時，就會造成海上事故，但這股海底的潛流又是怎樣形成的此也沒有一個較為合理的解釋。

1979年，美國和法國科學家組織的聯合考察組，在百慕大海域的海底發現一個巨大的水下金字塔。根據美國邁阿密博物館名譽館長查爾斯·柏里茲派人拍下的照片，可以看到這個水下金字塔比埃及大金字塔還要巨大。塔身上有兩個黑洞，海水高速從洞中穿過。

水下金字塔的發現，使百慕大三角謎變得更為神秘莫測，它到底是人造的還是自然形成的？它與百慕大海域連續發生的海難和空難有什麼關係？這些都有待於人們的進一步探討。百慕大這個黑洞，至今還沒有看見底。

此問題還在進一步調查、研究當中。