據說大理段氏皇族，當忽必烈帥軍越過蒼山，兵臨城下時，就逃到了昆明。後投降忽必烈被封為雲南總管，替元朝管理雲南直至明朝成立。所以現在還有很多老雲南人，不認同昆明作為雲南首府。

真正的大理段氏後人在朱元璋徵雲南後隱姓埋名，四處飄散，甚至有部分被明朝強制遷移到今山東地區。

大理段氏是個很神奇的存在，統治雲南400多年。公元937年段氏建立大理國，後歷經高氏篡位，高氏又還位段正淳，但世襲宰相掌握實權，段氏成為傀儡。後來蒙古人1253年滅大理，段氏反而成為歷史上結局最美好的亡國之君，被封大理總管，從傀儡皇帝變成掌握實權的一方諸侯。

1683年明朝徵雲南，打下昆明之後本來大理段氏已經投降，換取明軍不打大理。想在明朝也保持半獨立地位。結果朱元璋不許。

明軍打下大理，段氏徹底消失在歷史舞臺上，有部分段氏隱姓埋名星散到雲南各地，有被明軍俘虜的強制遷移。明朝為了徹底掌握雲南把大理相關史籍全部銷燬，徵雲南的軍隊留下不走，又在全國遷移了部分人口到雲南，大力推行漢文化。留下養子沐英永鎮雲南。