先說結論吧，發射井發射導彈可以被攔截，而且比較好攔截！

題主說的發射井發射的導彈一般都是彈道導彈，並且一般是核彈和戰略型大型彈藥。彈道導彈意味著彈道較為固定，發射升空，進入近地軌道，再入大氣層，也就是發射點和彈道都是已知的。

如果題主有所耳聞的話，很多愛好者在谷歌衛星地圖上找導彈發射井位置，甚至對於間諜來說標記和確認發射井位置成為一份專門的工作。所以發射井發射方法的弊端就一目瞭然了，你說可以遮蔽？不不不，施工的時候就已經被標註了，遮蔽已經沒用，一旦被纏住，發射的時候就已經被發現了，攔截已經啟動了。而且針對所有發射井的打擊已經啟動了！

導彈圈有云：兵貴機動

發射井的不能移動，容易被偵查到雖然防禦力強大但是畢竟不能一共，維護起來成本也遠高於機動導彈。但是發射井的導彈體積大，射程基本都超過1萬公里可以打擊世界的任何角落，如SS-18撒旦，東風5B。

而導彈車就不一樣了，機動性好，不容易遭到打擊，雖相對射程趕不上發射井的，但是這是彈道導彈的發展趨勢，如白楊M。實際情況優先發展的是核潛艇彈道導彈，在大海上隱蔽性更好更難以發現。特別是美國、英國、法國基本上以彈道導彈核潛艇為主。