準備考研需要準備的內容很多。題主問題在於選擇哪個方向進行考研準備。而不是選生理學還是藥理學的問題。如果要做獸藥研發相關專業學習深造就要選擇藥理學了。如果不是獸藥研究那就是生理學了。這都是專業基礎課程，只要學的明白，考哪個都不會是問題。

題主是要考研，方向已經選好343獸醫基礎，那麼考試要考啥，現在已經和你以後的專業沒有具體關係了，最重要的是要考上研究生。

343獸醫基礎考試範圍包括：動物學、動物生理學、獸醫病理學、獸醫藥理學、獸醫臨床診斷五個部分，每個部分75分，由考生任選其中兩個部分作答。

既然你只糾結於動物生理學和獸醫藥理學那麼你另一個已經選好。

如果你大學本科學習的是相關專業那麼就根據你的學習情況，難易程度選擇一個就好，你的最終目的是考上研究生，筆試是不會影響面試的。

如果你不是想過專業的大學生，沒有學習過相關內容，我覺得如果時間允許，你先都看一下，感覺一下那個更容易學習，就選擇那科。如果時間不允許，我建議選擇獸醫藥理學，這個科目相對而言屬於記憶性比較大的，不是特別深的，而動物生理學就相對而言比較微觀，比較接近實驗性，只有自己做的實驗，做過解剖才能更好理解，學習。