平板中生長的菌落，用經驗來看的話，一般大致是可以區分是哪一類的菌，但是你首先需要知道細菌，酵母菌，黴菌和放線菌在平板上的大致形態如何。

如果，在做平板的時候，用的培養基是選擇性培養基，比如接種時分別接種細菌培養基，酵母菌培養基，黴菌培養基的話，就大致可以將你的樣品中的微生物按照這幾類區分開來。

如果，不是選擇培養基的話，只能靠形態觀察了，身邊有顯微鏡是最好的，分別塗片觀察，可以依據形態，菌體大小，菌絲形狀等來快速判定。

最可靠的方法，是將每一個菌劃線分離成單菌落之後進行測序，不但能分類，具體是什麼微生物都能知道，而且，現在測序公司很多也很快，價格便宜，不到一百塊一個樣品。

一般來說，黴菌菌落是絨狀，表面乾燥，有些會有肉眼可見的黑色孢子；細菌菌落水滴狀，表面潮溼，多為乳白或者奶黃色。

從我個人的實踐來看，細菌之間憑肉眼觀察是無法區分的（下圖圖一是大腸桿菌菌落，圖二是根瘤農桿菌菌落）。

不過實驗室菌落培養都是有目的性的，細菌是工具，所以培養基中都會加入特異性抗生素比如Kanamycin, Rifampicin, Streptomycin等用來篩選。所以出現的菌落一定是你所想要的，含有外源質粒的細菌。