目前來說，對大多數起來，是統一要求將電子發票打印出來，與紙質發票一樣的方式進行報銷。當然少量企業實現了全程無紙化的報銷，直接網上提交就可以。

對多數企業來說，打印出來報銷就存在重複報銷的風險，因為打印出來的電子發票其實類似一張普通的列印件，基本上丟失了所有的防偽措施和標識，因此需要會計再報銷入賬的時候，想辦法防範重複報銷的情況。

電子發票的報銷方式分為兩種。第一種是如果公司本身的財務系統和操作流程已經全部電子化了，那麼電子發票的報銷就只需提交電子版本按流程走就OK了，但是有一點需要提醒的是根有些稅務機關要求∶必須有紙質票存檔。第二種情況是目前決大多數中小型企業在處理電子發票的報銷時還是需要打印出來走手工稽核批覆的程式，（電子發票打印出的版式檔案報銷是具有法律效力的，具體檔案見下圖1）但是打印出來的電子發票報銷就會遇到重複報銷和ps票的可能，那麼怎樣防止電子發票的重複報銷和PS票報銷呢？微信小程式《電子發票臺賬》就是一款專門解決電子發票的軟體工具，這個工具不但解決電子發票的重複報銷，還可快速錄入、自動生成臺賬報表已及針對ETC電子發票的智慧提取和統計。這款小程式是針對電子發票報銷和管理的最完善和最全面的一款軟體工具。

使用《電子發票查重工具》配置了真偽查驗功能，員工透過員工版上傳發票原件，會計再掃描二維碼進行稽核，就可以一鍵查重同時驗證真偽，還能夠得到員工上傳的電子原件。點選透過，系統會自動將發票資訊以及原件儲存並生成臺賬。如果稅局來查，臺賬可隨時匯出。