尿常規中的一些化學成份檢測可以透過分析儀器來檢查，但是細胞學檢查還是需要顯微鏡鏡檢。

這包括管型分類及計數，白細胞計數，紅細胞計數，異性紅細胞計數（判斷紅細胞是腎性出血還是非腎性的，需要相位差鏡檢）。

尿液分析儀，所採用的方法是幹化學試帶法。顧名思義，是透過化學方法檢測尿液中的物質，以此來判斷含量的多少或者有無。既然是化學方法，就無法避免體內其它一些化學成分相似的物質，或者外界汙染物的干擾。所以當儀器檢測到含有紅細胞、白細胞等物質時，需要用顯微鏡複檢。

其次，顯微鏡檢查還可以看到幹化學試帶法無法檢測的有形成分。比如，儀器檢測到尿蛋白較高，恰好管型的組成成分中有尿蛋白。而管型對於腎臟疾病的診斷和鑑別是有巨大意義的。所以一般看到尿蛋白，就要進行顯微鏡檢查，留意是否有各種管型。

顯微鏡檢查的有形成分還有，各種結晶（比如尿酸結晶，膽固醇結晶等），各種細胞，精子，甚至寄生蟲等。這些都是幹化學法無法取代的。

隨著科技水平的提高，尿有形成分的檢查也已經全面自動化。儀器連線顯微鏡，採集尿液中的異常有形成分的圖片，與資料庫中的圖片進行對比，自動判斷各種病理成分，大大節省了檢驗技師的工作量，而且比較容易控制檢測質量。