中藥灌腸在臨床上還是有一定治療效果的，比如治療直腸潰瘍，我們用連梅液治癒過多例患者；此外，中藥灌腸還可以治療習慣性便秘等等。

一.、中藥灌腸常用於小兒退燒

中藥灌腸比較常見的是用於小兒，比如很多小兒發燒，有一部分是因為積食引起的。大腸內積食無法及時的排出，為了快速退燒，醫生會採用灌腸的方法讓大便排出，起到一個快速退燒的目的。這個多用於嬰幼兒不能服藥的情況。

二、中藥灌腸用於慢性結腸炎

慢性結腸炎患者的常見症狀主要有：腹痛、腹瀉和便秘交替。由於很多人胃不好，吃太多的西藥以後出現胃疼、傷胃的情況。這時候會採用灌腸給藥的方法來減少藥物對脾胃和腎臟的損害。

三、中藥灌腸用於盆腔炎

盆腔炎為婦科的常見病。炎症可侷限於一個部位，也可幾個部位同時發病。灌腸療法一般是藥物經直腸到達盆腔，經直腸粘膜吸收後到肝臟，代謝後進入迴圈；不經過上消化道，可避免胃酸和酶對藥物的影響，同時也避免了對胃腸的刺激；

50%藥物避免了肝臟，減低了對肝臟的副作用；部分藥物直達盆腔，使病所藥物濃度高，作用強。