秦始皇陵究竟有沒有被盜，秦陵原考古隊隊長段清波就表示“不敢妄然下結論”，“只能在挖掘開來後才能有定論”。在段清波看來，秦陵被盜一事，正史曾有過記載，如漢代就提及項羽曾盜過秦陵，但這些文獻提供僅僅是線索，是需要考證的。

北京大學歷史學系博士生李寶柱曾經撰文披露：秦始皇陵地宮早在一千多年前，就已經被人盜掘。現今的地宮，是宋朝初年再葬時重修的，地宮裡秦始皇的棺槨是宋朝重新制造的，裡邊所用的金銀財寶也全是假的。

李寶柱的依據源於清人徐松從《永樂大典》所輯出的《宋會要輯稿》。據《宋會要輯稿》記載：“開寶三年（970年）九月六日，河南府京兆、鳳翔府耀州上言，先準詔，檢校歷代帝王陵寢，內周文王、成王、康王，秦始皇……二十八陵曾經開發。詔：每帝制造禮衣一幅，帝服一襲，具棺槨重葬。”

李寶柱據此推斷：截至宋初，在五代或是唐朝末年，歷代帝王陵寢，包括秦始皇陵在內，就有二十八座已經被盜掘（“開發”）。而且被破壞得相當嚴重，以至於大宋朝廷不得不出巨資，動用一千兵丁進行再葬。

李寶柱所引用的《宋會要輯稿》，是從《永樂大典》中輯出的《宋會要》原稿，其可信度是有的，但皇帝下了詔書，未必就得到執行。