殺菌劑的種類很多，按照它的作用方式可分為三類。 1、植物保護劑 春天的時候，我們會經常看到園丁在樹幹的底部塗上一層白色的物質，這就是保護劑的一種波爾多液。這類藥劑分佈在植物體的表面後會形成一層藥膜，病原微生物接觸到藥膜後會被殺死，保護植物免受其害。這類保護劑除了波爾多液外，還有代森鋅、百菌清等。這種殺菌劑由於對植物體的副作用小，得到了廣泛的應用。

2、植物治療劑 如果病原微生物已經浸入植物體內，但植物表現病症處於潛伏期。這時就要使用治療劑了。使用治療劑後，藥物從植物表皮滲入植物組織內部，經輸導、擴散、或產生代謝物來殺死或抑制病原，使病株不再受害，並恢復健康。具有這種治療作用的藥劑主要有多菌靈、託布津、春雷黴素等。

3、植物剷除劑 指植物感病後能直接殺死已侵入植物的病原物的藥劑。這是一種強力殺菌劑。但不能用於生長期間的花卉，如果在植物的生長期用剷除劑會對植物造成一定的傷害。剷除劑適用於剷除休眠期間花卉表面的病原菌，同時，對土壤也有消毒作用。這類藥劑常用的有石硫合劑、福美砷、五氯酚鈉、石硫合劑等。