保安局隸屬於香港特別行政區政府，是香港政府“三司十三局”之一，局長級別比司長低，但保安局直接對行政長官負責，與政務司沒有直接隸屬關係，警務處是保安局的下屬單位。除行政長官外，香港政府由三層架構組成：

行政長官是香港政府的政府首腦，負責領導香特別行政區政府，此職位成立於一九九七年，大致代替香港總督的職權。轄下由三層架構組成：

第一層是司長，即政務司司長、財政司司長和律政司司長。他們均是由行政長官委任，負責制訂香港政府最主要的政策，並直接向行政長官負責。

第二層是決策局，又稱為政策局，職能類似英國政府的部長，負責制訂、統籌及檢討特訂範籌，如衛生、運輸、保安等的政策，和監督屬下執行部門的工作，所有決策局又共同組成政府總部，前行政長官董建華於2002年7月1日實行問責制之前，所有決策局均只向政務司司長或財政司司長負責；實行問責制後，改為直接向行政長官負責。

第三層是部門，是政府政策的執行部門，例如衛生署、警務處等，首長皆為香港公務員。

另外少部分政府部門如廉政公署及審計署皆直屬行政長官。