根腐病發病初期莖基或根部產生褐斑，逐漸擴大後凹陷，嚴重時病斑繞莖基部或根部一週，致地上部逐漸枯萎。縱剖莖基或根部，導管變為深褐色，後根莖腐爛，不長新根，植株枯萎而死。

以孢子或卵孢子在病殘體上越冬，借灌溉水或雨水傳播蔓延。高溫高溼容易發病。該病多見於管理失誤造成，如定植後地溫低，土壤溼度過高，且持續時間長，或塑膠棚室栽培番茄遇連陰天未能及時放風，形成高溫高溼條件，尤其是大水灌後未能及時放風、排溼等都會導致該病發生和流行。

預防植株患病，具體方法如下:按8至10克/平方米的用量，將多菌靈可溼性粉劑均勻撒在畦面上，然後放緩水衝施，使藥劑滲入地下。如果植株已感染根腐病時，可用90%敵克松粉劑500至1000倍液灌根，每棵0.25至0.5公斤即可。發病初期也可以用50％根腐靈可溼性粉劑800倍液或12．5％增效多菌靈濃可溶劑200倍液灌根，隔7～ 10天1次，連續灌2～3次。

根腐病，先去把土壤處理好，調節好酸鹼度，用甲霜惡黴靈或者惡黴靈殺菌，再用有機肥補充有機質，用菌肥補充有益菌，用氨基酸和微生物菌劑灌根或者淋根，生根壯苗，還抗病，單純用藥效果不好，綜合治理才是關鍵