天然藥物化學是運用現代科學理論與研究方法研究天然藥物中的化學成分的一門科學。其研究內容包括各類天然藥物(主要是生理活性成分或藥效成分)的結構特點、物理化學性質、提取分離方法以及主要型別的化學成分的結構鑑定等。此外，還涉及主要型別的化學成分的生物合成途徑等內容。

生藥學是應用本草學、植物學、動物學、化學、藥理學和中醫等學科知識來研究生藥(藥材)的名稱、來源、生產、鑑定、化學成分和醫療用途的科學。生藥學的研究內容包括：中藥材的品質評價研究、本草學研究、資源開發、細胞組織培養等。生藥學科已經逐步擴充套件到應用植物化學、植物化學分類學、生物化學、細胞生物學、植物生理學、遺傳學等學科來研討天然藥物的來源、分類、資源開發、生產、品質評價、生物合成、藥效、藥理、毒性等內容。

目前國內天然藥物化學與生藥學的研究物件主要是傳統中藥、民間用的草藥，還包括動物藥、海洋藥物。這兩個學科互相交叉，並且都都逐漸引入生命科學研究技術，如利用生物晶片進行天然藥物成分的活性篩選，對生藥種屬進行DNA研究。