1、品種不同。

青花椒為芸香科植物青椒的乾燥果皮。主產遼寧、吉林、黑龍江、河北、江蘇等地。紅花椒為芸香科植物花椒的乾燥果皮。主產河北、山西、陝西、甘肅等地。在青海、山東、四川、湖北等省亦有分佈。

2、外觀不同。

青花椒多為2～3個上部離生的蓇莢果，直徑3～4mm，頂端具短小喙尖。外果皮表面呈灰綠色、黃綠色至棕綠色，有網紋及多數凹下的小點狀油腺;內果皮光滑，灰白色或淡黃色，與外果皮分離或捲起，殘存種子卵形，黑色有光澤。氣香，味微甜而後辛。紅花椒果實基部有小果柄及1～2個未發育的顆粒狀離生芯皮。外果皮表面呈紅棕色或紅紫色，皺縮，有多數點狀突起及凹下的油腺;內果皮光滑，淡黃色，薄革質，常由基部與外果分離而反捲。殘留種子黑色，有特殊香氣，味麻辣而持久。

3、麻味程度不同。

紅花椒的麻味沒有青花椒那麼濃烈。紅花椒比較適合炒菜、燉湯。用於製作辣味重，偏重香辣風味的菜，比如辣子雞、香辣魚等。青花椒麻味重，比較適合用來做花椒油，或者是煮菜，比如花椒魚，椒麻雞、青椒兔等。