琉球人的祖先來自哪裡大約有五種說法。

第一種說法稱琉球族是百越的後代，這種說法主要為中國學者所堅持。其主要理由是秦統一六國的過程中，在南方拓展領土時，不少百越民族因不願意成為秦始皇的附庸，紛紛向更遠的地方逃離。其中應當有不少百越族人逃至臺灣島、琉球島甚至日本的九州島上，成為當地百姓的始祖。

第二種說法為西方學者所堅持，認為琉球族與印尼或澳洲的原住民同源，屬馬來人的分支。其主要依據是琉球語的獨特的發音，琉球語與日語並不相同，反倒是和廣闊太平洋上的南島語系一些語言相關。但是，在古代時，琉球語所使用的文字倒是中國的漢字。

後三種是日本學者所堅持。一種是琉球人與阿伊努人、大和族同源，一種是認為琉球族自日本列島遷入，為日本人的一個分支，還有一種則是琉球人也是中國古籍中所提到的“倭人”的一支。然而，這些說法，主要是為日本侵略琉球尋找史料支撐，其實並不值一道。

由上，筆者倒是認為第一種和第二種可能都對琉球人的形成有所影響，來自中國百越民族後代佔得比重可能更大一些。