六神曲與建神曲均為曲類,因曲類多產在福建,以泉州此地產的質優,故六神曲又有建曲之稱,因此人們往往認為建神曲就是六神曲,而實際上兩藥雖然在製作工藝上基本相同,但在藥物組成和功效上卻有所區別。　　六神曲和建神曲同為發酵製成的曲劑，但兩者處方、製法、功效皆不同。　　六神曲 由鮮辣蓼、鮮青蒿、鮮蒼耳子切碎，杏仁、赤小豆研末，和入麥麩、白麵後，經發酵而成的曲劑，含有大量的酵母菌及揮發油、甙類、脂肪油、維生素B等成分，性溫，味甘辛，具有健脾和胃、消食調中的功效。《本草正》曰：“神曲，味甘氣平，炒黃入藥，善助中焦土髒，健脾暖胃，消食下氣，化滯調中。”　　建神曲 由枳殼、枳實、香附、白芍、莪術、首烏、白扁豆、元胡、檳榔、良姜、青皮、川椒、大黃等43味藥研為細末，加入碾碎的赤小豆、小麥、麥皮、麵粉，再用青蒿、赤柱草、蒼耳草煎湯，與上藥和勻充分發酵，外表長出黃色菌絲後曬乾烘烤，儲藏4個月後再曬，刷去黴毛即可入藥。其性溫，味苦，具有健脾消食、理氣化溼、解表功效。　　此兩種藥雖同有健脾消食的作用，但建神曲含有薄荷、防風、荊芥、紫蘇、柴胡等解表藥，能搜風解表，對感冒頭痛、頭眩發熱，加生薑煎湯溫服，有很好的發汗解表作用；六神曲則沒有解表作用。兩藥僅一字之差，但六神曲不等於建神曲，故不可相互代用