兩款產品的主攻方向不同，360安全衛士主攻PC電腦防護，360防毒主攻病毒查殺。兩者的詳細不同點如下：1、在保護電腦系統不被破壞層面上，360安全衛士功能比360防毒強大；在防毒能力上，防毒強於安全衛士。（1）360安全衛士擁有查殺木馬、清理外掛、修復漏洞、電腦體檢、電腦救援、保護隱私、清理垃圾，清理痕跡多種功能。（2）360防毒整合了五大領先查殺引擎，包括國際知名的BitDefender、Avira(小紅傘)、360雲查殺、360主動防禦以及360第二代QVM人工智慧引擎。3、在自我保系統方面，360安全衛士有完善的自保系統，360防毒沒有，而且要依靠安全衛士。在沒有安裝安全衛士，下載360防毒安裝後，防毒會立馬後臺下載安全衛士自保模組，360sd安裝目錄的同級目錄多了一個360safe的目錄。4、在引擎使用方面，360安全衛士用的都是360自產引擎，而360防毒採用了自產和國外頂尖引擎的技術融合，為的是將防毒能力做到極致，360防毒在國際上也獲得了很多獎項。

兩款軟體的主要功能不一樣: 360安全衛士重在查殺木馬,保證使用者的電腦賬號,並且清理垃圾最佳化加速; 而360防毒軟體則是為了防毒。