腐殖質對元素的遷移主要表現為有機膠體對金屬離子的表面吸附和離子交換吸附作用，以及腐殖酸對元素的整合作用與絡合作用。

在腐殖質豐富的環現中.Cu.Pb.Zn.Fe.Mn.T.Ni 等元素可稱有機膠體吸附，並隨水大量遷移。腐殖質與Fe.Al.Ti.U.V 等重金屬形成絡入物.較易溶於中性、弱酸性和弱鹼性介質中,並以絡合物形式遷移在腐殖質缺乏時，它們便形成難溶物而沉澱。

有機肥料的腐熟是一個複雜的過程。有機物質在土壤微生物作物下才能進行礦質化和腐殖化的過程。要使有機物質分解，釋放養分就必須依靠微生物的活動才能實現。

在腐熟過程中，有機物質的分解與合成是同時進行的。

一方面，一些有機物質由複雜的形態轉變為簡單的形態，由不溶於水的物質轉變為水溶性的物質，從而提高養分的有效性，使養分易被作物吸收利用，這就是礦質化作用；

另一方面，一些簡單的化合物或分解過程中的中間產物，在微生物的作用下，重新合成為複雜的化合物，最後可合成為腐殖質，這就是腐殖化作用。

因此，腐殖質的產生是有機肥料腐熟的重要標誌，其含量的多少與有機肥料的質量有密切的關係。