女貞子功長滋補肝腎、清虛熱、烏須明目，有助於緩解肝腎陰虛之目暗不明、視力減退、眩暈耳鳴、腰膝痠軟、骨蒸潮熱、鬚髮早白等。

不過中醫臨床用藥，多以複方配伍的形式，單藥成方者極為少見。女貞子的使用，亦主要以組方配伍的形式出現。如：女貞子配伍墨旱蓮，不僅可組成著名的方劑二至丸，也是臨床常用的配伍藥對。二者配伍使用，女貞子益肝腎之陰，補而不膩不燥；墨旱蓮滋補肝腎，養陰而不膩滯。兩藥滋養而不礙胃，清涼又不苦寒，相須為用可增強補肝腎陰、清熱涼血之力，常被用於緩解肝腎陰虛所致之月經不調、不孕、更年期綜合症，以及心腦系統疾病等。

現代藥物化學和藥理學研究表明，女貞子中含有豐富的脂肪油、環烯醚萜類、三萜類、黃酮類、苯丙素類化合物，以及糖類、氨基酸等，具有抗炎、免疫調節、抗衰老、保肝護肝、降血糖、降血脂、促進毛囊生長等多種藥理活性。

除了上述作用，女貞子也常可與白朮等中藥材配伍，緩解老年虛性便秘。這是由於女貞子中含有的右旋甘露糖醇，可使大腸內滲透壓增高，保持腸道充足的水分及具有緩瀉作用；而其所含豐富的脂肪油，又可潤腸通便，藥性柔和而功效獨到，不失為此類疾病較佳的選擇藥物。