早期拓甲骨文，都要用到白芨水。白芨是一種中藥材，把它浸泡在溫水裡，會產生一種弱膠質。當天制好的白芨水用於拓印，對甲骨的侵蝕很小。但是時間一長，白芨水的膠質就會變厚，哪怕只隔了一天，都會粘在甲骨上面。而且蟲子特別喜歡吃這種植物膠，最後會汙染甲骨、蛀蝕甲骨，產生風化、開裂等現象。所以過去在傳拓甲骨文的同時，多少會造成甲骨的損傷。

考慮到用白芨水墨拓會汙染甲骨，研究人員提出用純淨的蒸餾水或特製的去離子三級水代替白芨水進行拓制的方法。這種水使拓紙與甲骨粘緊，對甲骨幾乎沒有損傷，而被甲骨所吸收的微量水分，可以慢慢自然蒸發。這是甲骨墨拓技藝一大創新，等於把傳統的墨拓技術提高到了一個新的層面。

有的甲骨品相好，比較堅硬，用人頭髮刷敲沒有問題。但是有的甲骨，比如表皮已經風化起翹的甲骨，難免與拓紙粘連不牢，只能輕輕地刷。人頭髮刷的力道不足，有的字口顯不出來，如果仍舊用輕敲的方法，就會對甲骨造成損傷。研究人員嘗試使用馬鬃刷。馬鬃，就是馬脖子上的一綹長毛。馬鬃刷不硬不軟，恰到好處，一刷字口就出來了，而且也不傷甲骨，這又是技術上的精益求精。馬鬃刷的使用，在“保護第一”的情況下把甲骨文整理工作又往前推進了一步。