基因（Gene,Mendelian factor），也稱為遺傳因子。是指攜帶有遺傳資訊的DNA或RNA序列並控制生物性狀的基本遺傳單位。 基因透過指導蛋白質合成來表達自己所攜帶的遺傳資訊，從而控制生物個體的性狀表現。 在自然群體中往往有一種佔多數座位的等位基因，稱為野生型基因。與之相對的是突變型基因. 在目前的研究中是把從大自然中獲得的個體，也就是非人工誘變的，作為野生型，那麼它所攜帶的就是野生型的基因組。 但事實上，自然界本身就發生了很多的突變，然後進行選擇，得到的同一個物種會有許多不同的生態型（ecotype），通常是取自不同的產地。對於同一個基因，不同生態型的序列會不一樣，但都是野生型的。 對於已經測序的序列可以透過PCR鑑定，但是對於沒有測序的物種可以用比較傳統的一些方法，比如酶切長度多型性來區別。 與野生型基因相對的是突變型基因 突變型基因：一座位上的其他等位基因一般都直接或間接地由野生型基因透過突變產生。相對於野生型基因，稱它們為突變型基因。

但事實上，自然界本身就發生了很多的突變，然後進行選擇，得到的同一個物種會有許多不同的生態型（ecotype），通常是取自不同的產地。對於同一個基因，不同生態型的序列會不一樣，但都是野生型的。在相同的生態型背景下進行的，突變基因在序列上會有單一核苷酸位點突變。