錫爾河位於費爾幹納盆地中的支流因河水大量用於灌溉，大多已流不到錫爾河。錫爾河從費爾幹納盆地流出後轉向西北，右岸支流有阿漢加蘭河(Akhangaran)、奇爾奇克河(Chirchik)、克列斯河(Keles)和阿雷斯河(Arys)。錫爾河的中、下游水道逶迤曲折，經常改道，一些水道於乾旱季節消失在沙漠中，而在洪水季節河水則會溢位低矮的河岸。錫爾河及其支流灌溉的土地面積在200萬公頃以上，費爾幹納盆地和錫爾河中游農作物以棉花為主；下游產稻米。 此水流域系葛邏祿等突厥語遊牧民族活動之地。據中國史書記載，昭武九姓中的石國建都於此水支流。

全長3019千米，河口附近年平均流量約446立方米/秒，年徑流量14.1立方千米，河水補給主要來自融雪，其次是冰川。上游河段流經山地，每年3、4月至9月水位較高。含沙量大，大部沉積在卡札林斯克(Kazalinsk)下游，每年三角洲向鹹海推進50米。12月到翌年3月為下游封凍期。卡札林斯克下游和以上部分河段可通航。錫爾河畔有水電站多座，以法爾哈德(Farkhad)、凱拉庫姆(Kayrakkum)、恰爾達拉(Chardara)等水電站為最大。在克孜勒奧爾達(Kzyl-Orda)和卡札林斯克還築有攔水壩。