交底書是給代理人看的，代理人根據交底書內容瞭解你的要申請的專利內容，然後給你寫成專利檔案，代理公司還會處理後續遞交所需的檔案等等流程事項。

既然你喜歡科研，研究出成果若要得到保護的話，論文是一方面，專利是另一方面，不論學習還是工作之後，做研究的人員申請專利可能性很大。申請的時候，要不就是你自己申請，自己寫申請檔案（這個更難學且寫好了不容易，完成所需花費時間更長，要求更多），然後自己遞交（查詢遞交流程，對應填寫各種表格等），並處理後續繳費以及答覆審查意見過程。很多學校以及大部分公司都會選擇委託代理機構處理所有事情，這樣申請人要做的事情就是提供交底書，以及在各種已經做好的合同和表格上蓋章，更省事一些。

相比交底書和申請檔案，肯定是交底書容易寫了，交底書寫出來的目的是為了讓代理人看懂你要申請的內容，因此只要寫的清楚完整就可以了，後續還可以電話溝通補充。申請檔案分為五部分，每部分有不同的內容及格式要求，哪些話在哪部分中能寫哪部分不能寫，保護範圍寫多大，佈局怎樣安排，權利要求怎樣上位，語句怎樣更簡潔等等很多內容要注意。

綜上來說，我認為導師讓你寫交底書是為了申請專利做準備，就像是要吃飯讓你先洗了菜一樣，後續切菜炒菜放調料的步驟有別人來做呢。