由於孤獨症兒童與智障兒童都屬於腦結構存在缺陷，但他們之間語言形成方式還是有很大的區別。

智障兒童的語言是在莫須有的意境中產生混亂言語，讓人摸不到語意產生的源頭是什麼？因為，這些孩子大腦中杏仁核記憶功能相對很弱。

而孤獨症兒童的語言，是受到外界刺激源的影響，在孩子大腦中杏仁核記憶功能是相當強大的，這是一種特殊能力的表現。

僅管孤獨症語言表現為回聲語言，但我們可以從環境、場所、聲、光、人等實際存的因素為刺激源，找到語意的內容。

所以，智障兒童表述的語言大多是無根之木，而孤獨症兒童表述的語言內容是有所指向。

孤獨症與智障的語言障礙有本質的區別，孤獨症譜系障礙 (autistic spectrum disorders,ASD)是一組以社交溝通障礙、興趣或活動範圍狹窄及重複刻板行為為主要特徵的神經發育性障礙。尤其在認知、社交-情感和語言領域影響比較大。語言障礙的特徵是語言的運用障礙，可以有自發性的言語，大部分理解能力尚可。

智障的語言障礙為語言的理解和表達能力同時受限，理解能力更差一點，表現為語言與智力發育遲緩，但一般無行為和感知覺障礙。