身體內的糖主要以肌糖原、肝糖原和血糖的形式存在，其中肌糖原400-600g，肝糖原100g左右，血糖5g左右。肌糖原雖然較多，但基本均勻分佈於肌肉組織中，所以平均到每一塊肌肉中的肌糖原數量也不算很多。

糖作為一種高效能量物質，即可參與無氧代謝也可參與有氧代謝，而且是運動中身體的“首選”能量底物。如果是大強度的無氧代謝，那不用說，只能消耗糖原。如果是低強度的有氧代謝，雖然也可以利用脂肪和蛋白質作為能量底物，但是由於糖的高效性，依舊是身體的首選能量底物。

運動過程中，目標肌肉裡的肌糖原首先被利用，而身體其他部位的肌肉雖然還有充足的肌糖原，但並不會被調動來補充目標肌群的肌糖原“缺口”。血糖由於要為大腦等臟器供能，所以濃度變化很小。這時要保持運動就需要調動肝糖原來補充這個肌糖原的“缺口”。不過即使有肝糖原的補充，肌糖原在持續的運動中還是會大量被消耗，一次大量運動後肌糖原徹底恢復需要24小時左右。

但是如果運動後2-4小時內及時補充碳水化合物和蛋白質的混合物可以快速補充肌糖原並促使肌糖原產生超量恢復，也就是經常鍛鍊的肌肉中肌糖原含量會更高。肌糖原即是無氧運動的供能底物，又是有氧運動的供能底物，所以肌糖原水平的提升對無氧運動和有氧運動都有幫助。