百合發芽後，往往以追施氮磷鉀複合肥即可。但百合的種球有時第一年是無法順利開花的，尤其是使用了生長時長短、發育不是非常成熟的種球來繁殖的百合幼苗。種植後的第一年往往以養球為目的，到了第二年一般就能順利開花了。

為了更好地促進百合發芽和生長，一般建議大家在上盆時施足底肥，通常以動物骨粉為宜，可以為植株補充不少磷、鈣元素，同時還能補充一些其它的微量元素。這對於促進百合種球的生根發芽來說具有重要作用。

骨粉中富含磷、鈣元素，同時還含有多種礦物元素，將其作為百合上盆時的底肥使用，對於促進植物根系的生長，壯大其種球是非常有幫助的。對於植株後期開花也能奠定良好的基礎，而且骨粉一般也適合作為基肥使用。

百合生根發芽後，如果追肥的話，主要是定期追施一些稀薄的複合肥，同時也可以配合施用一些花多多。這樣，不僅利於植株的生根發芽，讓植株長勢更加旺盛，還能對植株後期的開花起到很好的促進作用。

當然，百合畢竟也是一種喜酸性花卉植物，要求盆土呈偏酸性，如果盆土鹽鹼化的話，必然會影響其生根發芽，植株長勢自然也不好。所以，我們也可以適當為植株施用一點硫酸亞鐵溶液來改善土質。適當地提高盆土酸度，可以更好地促進百合花的生長。