這裡有兩個結論先提示一下：

這兩個結論並不自相矛盾，簡單解釋一下：

小產權房的房產證出具機構（不管是開發商、還是鄉政府等），本身不具備出具房產證的合法資格。所以，能不能登記為雙方名字，主要看出具機構的“臉色”——反正不受法律保護。

至於未來小產權房如何走，目前不敢有什麼判斷，但是至少有一條結論：不改變其“非法”屬性，不能轉正——這在今年兩會之前再次三令五申。

所以說，題主提到的問題，有兩種處理方式：

夫妻離婚後，辦房產證也可以寫雙方的名字。

首先，小產權房是指在農村集體土地上建設的房屋，未辦理相關證件，未繳納土地出讓金等費用，其產權證不是由國家房管部門頒發，而是由鄉政府或村頒發，亦稱"鄉產權房"。"小產權房"不是法律概念，是人們在社會實踐中形成的一種約定俗成的稱謂。購房合同在國土房管局不會給予備案。按照國家的相關要求，"小產權房"不得確權發證，不受法律保護。

最後，如果離婚對於婚內房產的處置，最好在離婚時約定清楚，房子歸一方，拿到房子的一方給另一方經濟補償，以免日後再發生不必要的糾紛。