1.培養目標不同學碩是以培養科研人才為主，職業目標為大學教師和科研機構研究人員，側重理論教育。學生畢業後可獲取學歷、學位雙證，社會認可度比較高。專碩側重理論研究和實踐應用，最突出的特點是學術性和職業性相結合。2.培養方式不同學碩側重基礎理論學習，學制為3年。專碩以實際應用為導向，學習過程中至少有半年時間的實踐環節，學制一般為為2年，但有的學校已經將專碩和學碩的學制都統一到了3年。這方面還需瞭解清楚。3.報考條件不同除了工商管理等專業之外， 大多數學碩對報考者沒有工作經驗要求。4.學費差異一般而言，學碩專業一年的學費為8000—10000元。專碩學費較高，一般為8000—15000元。5.難易程度不同這一點表現最明顯的就是英語一和英語二的差別。僅僅從考試大綱上看，英語一比英語二的考查點多出好幾個。整體難度上，前者自然比後者大一些。

培養方向不同：學術型碩士教育以培養教學和科研人才為主，授予學位的型別主要是學術型學位；專業型碩士是國家為了克服學術型碩士的不足新增的一種新碩士，培養的是市場緊缺的應用型人才。