通常萃取蜂膠的方法有

1、酒精萃取蜂膠 酒精萃取法，是一種最傳統的蜂膠純化方式。因為蜂膠大部份的有效成份（如生物類黃酮），大多是非水溶性的，必須藉由酒精將其萃取出來。藉由此方法所溶出的有效成份，是目前已知的萃取法中含量最多的，最高可達60%-70%，也因此市面上的蜂膠製品，以酒精萃取最為普遍。但是，跟據國家食品安全法規定，食品中的酒精含量不得高於30%。

2.丙二醇萃取法 即一般標榜的不含酒精蜂膠，實際上是以丙二醇取代酒精來溶解蜂膠。丙二醇對蜂膠的溶解度比酒精差，目前最高可達40%，但丙二醇本身即具有黏稠性，因此丙二醇蜂膠液的有效成分量雖然較低，但它的黏稠狀卻較高。

3.二氧化碳超臨界萃取法 將蜂膠原塊與以一定比例之食用酒精置於容器內經浸泡、攪拌、過濾雜質後即得到蜂膠液。將蜂膠原塊與以一定比例之食用酒精置於超臨界液體萃取槽，灌入高壓液態二氧化碳，並設定於特定之萃取技術條件，而得到純化萃取之精華。

一般情況下，二氧化碳超臨界萃取生產的產品品質特點更高。