轉生鼬死後，眼睛被追求力量的弟弟佐助移植而形成新的永恆萬花筒寫輪眼。第四次忍界大戰時期，鼬被藥師兜用“穢土轉生”重新召喚至人世，開戰後和被穢土轉生的長門一起行動。在戰場上與鳴人相遇，藉助之前交給鳴人的力量“守護木葉”脫離了穢土轉生的控制，詢問鳴人佐助的動態並安心地把佐助託付給鳴人，並且幫助鳴人和奇拉比封印了長門。他告誡鳴人：“並不是成為火影的人就會被大家所認可，而是被大家所認可的人才能成為火影。”之後鼬決定親自去阻止穢土轉生，在路上與佐助相遇，被佐助問及關於自己的真相。後來鼬和佐助聯手在洞穴中對抗兜，兄弟羈絆再現。兜一直在挑撥佐助與鼬之間的關係，希望佐助站到自己這邊來，鼬叫佐助不要聽兜的，並說了最感人肺腑的一句話“不論村子有多麼黑暗，有多少矛盾，我都是木葉的宇智波鼬”。在戰鬥中，鼬向兜施展了與“伊邪那岐”一對的另一個究極瞳術——決定命運的“伊邪那美”，使兜陷入永恆輪迴的命運之中，並利用幻術得知了解除穢土轉生的結印方法，因而解除了穢土轉生。在穢土轉生即將解除之際，鼬對佐助說“不論你選擇什麼樣的道路，我都一直深愛著你”，之後靈魂昇天。