1．定義 　　經淨制或處理後的藥物，在一定的溫度和溼度條件下，由於黴菌和酶的催化分解作用，使藥物發泡、生衣的方法，稱為發酵法。 　　2．發酵的主要目的 　　改變原有效能，產生新的治療作用，擴大用藥品種。如六神曲、淡豆豉。 　　增強療效。如半夏曲。

　　3．發酵的操作方法 　　根據不同品種，採用不同的方法進行加工處理後，再置溫度、溼度適宜的環境下進行發酵。常用的方法有藥料與麵粉混合發酵，如六神曲、建曲、半夏曲、沉香曲等。另一類方法是直接用藥料進行發酵，如淡豆豉、百藥煎等。 　　發酵條件與發酵過程是微生物新陳代謝的過程，因此，在製備時，應具備其生長繁殖的條件。

　　　　［菌種、營養物質（培養基）水、溫度、相對溼度、其他方面］ 　　4．發酵品的質量要求 　　氣味要芳香無黴味、酸敗味。 　　曲塊表面黴衣黃白色，內部有斑點為佳。黑色質差。 　　5．注意事項 　　原料在發酵前應進行殺菌、殺蟲的處理，以免雜菌影響發酵質量。

　　發酵過程必須一次完成，不能中斷，或中途停頓。 　　溫度和溼度對發酵的速度影響很大，溫度過低或過分乾燥，發酵速度會慢甚至不能發酵，而溫度過高則能殺死黴菌，不能發酵。